在劳动仲裁过程中，如果公司不出席，仲裁庭将依法进行缺席裁决，员工的合法权益仍能得到有效保护。若公司不履行裁决，员工可向法院申请强制执行。以下是对这一问题的详细分析：
一、仲裁庭的处理方式
缺席裁决的法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第三十六条，被申请人（即公司）收到书面通知后，无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，仲裁庭可以进行缺席裁决。这意味着，即使公司不参与仲裁庭审，仲裁程序仍会继续进行，并不会因此中止或取消。
缺席裁决的具体实施：
- 仲裁庭在缺席裁决时，将主要依据员工提供的证据和陈述来认定事实，并作出裁决。因此，员工在仲裁前应充分准备相关证据，如劳动合同、工资单、考勤记录等，以支持自己的主张。
二、对公司权益的影响
丧失答辩和质证机会：
- 公司不出庭将无法对员工提出的主张进行答辩，也无法对员工提供的证据进行质证。这将导致仲裁庭主要依据员工提供的证据来认定事实，可能使公司在仲裁结果上处于不利地位。
承担不利裁决后果：
- 由于公司未参与庭审并充分表达自己的观点和提供相关证据，仲裁庭可能会根据员工提供的证据和主张作出对公司不利的裁决，如支付拖欠的工资、经济补偿等。
三、后续措施与权益保障
裁决的生效与执行：
- 缺席裁决作出后，只要裁决书依法送达双方，且未在规定时间内（一般是自收到仲裁裁决书之日起十五日内）向人民法院提起诉讼，该裁决即发生法律效力。这意味着，裁决书一旦生效，就具有法律约束力，公司必须履行。
申请强制执行的期限与条件：
- 如公司不履行生效的仲裁裁决，员工有权向法院申请强制执行。申请执行的期间为二年，自法律文书规定的履行期间的最后一日起计算。员工需准备好仲裁裁决书、强制执行申请书等相关材料，向有管辖权的人民法院提出申请。
执行措施：
- 法院在执行过程中，有权采取多种强制措施，如查询、冻结、划拨公司的银行存款，查封、扣押、拍卖、变卖公司的财产等。这些措施旨在确保员工的合法权益得到切实实现。
四、建议与指导
- 员工应积极准备证据：在仲裁前，员工应充分准备相关证据，以支持自己的主张。这些证据应真实、合法、有效，并能够证明公司与员工之间的劳动关系以及公司存在的违法行为。
- 员工应了解仲裁程序：员工应了解劳动仲裁的程序和规定，包括仲裁庭的组成、开庭时间、举证责任等。这有助于员工更好地参与仲裁程序，维护自己的合法权益。
- 若公司缺席，员工仍应坚持主张：即使公司缺席仲裁庭审，员工仍应坚持自己的主张，并充分陈述事实和理由。仲裁庭将依法进行缺席裁决，员工的合法权益仍能得到有效保护。
总结来说，即使公司在劳动仲裁中不出席，员工的权益仍能得到有效保护。员工应积极准备证据，了解仲裁程序，并在必要时向法院申请强制执行以维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。