在劳动仲裁过程中，如果公司不出席，仲裁庭将依法进行缺席裁决，员工的合法权益仍能得到有效保护。以下是详细的分析和建议：
一、仲裁庭的处理方式
缺席裁决的法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第三十六条，被申请人（即公司）收到书面通知后，无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，仲裁庭可以进行缺席裁决。这意味着，即使公司不参与仲裁庭审，仲裁程序仍会继续进行，并不会因此中止或取消。
缺席裁决的具体实施：
- 仲裁庭将依据员工提供的证据和陈述进行审理，并依法作出裁决。因此，员工应充分准备自己的证据和陈述，以证明自己的主张。例如，若主张未签订劳动合同的双倍工资差额，需提供工资条、工作证、考勤记录等证据来证明劳动关系及工资水平。
二、公司的不同情况及处理方式
公司无正当理由拒不到庭：
- 仲裁庭将直接进行缺席裁决。员工应抓住机会，清晰、准确地陈述自己的诉求和事实依据，并提供充分的证据支持。
公司有正当理由无法到庭：
- 公司应在开庭前向仲裁庭提出延期开庭的申请，并提供相应的证明材料，如突发疾病证明、不可抗力事件证明等。仲裁庭会根据实际情况决定是否准许延期，并重新确定开庭时间，通知双方当事人。若公司未提出延期申请或申请未获准许而仍不到庭，则视为无正当理由拒不到庭。
三、员工的应对策略
充分准备证据和陈述：
- 员工应提前整理好与案件相关的所有证据，包括劳动合同、工资条、工作证、考勤记录、聊天记录、邮件往来等。同时，准备好清晰的陈述，包括纠纷的经过、自己的诉求以及法律依据等。
积极参与仲裁程序：
- 即使公司不出席，员工也应积极参与仲裁程序，按照仲裁庭的要求提供证据和陈述。这有助于仲裁庭更全面地了解案件情况，从而作出更公正的裁决。
了解后续执行流程：
- 如果仲裁庭作出了对员工有利的缺席裁决，而公司在规定的期限内不履行裁决义务，员工可以向人民法院申请强制执行。因此，员工应了解强制执行的申请流程和相关要求，以便在需要时及时采取行动。
四、后续执行问题
执行申请：
- 员工需准备好仲裁裁决书、强制执行申请书等相关材料，向有管辖权的人民法院提出申请。人民法院会对申请进行审查，符合条件的，将采取查询、冻结、划拨公司的银行存款，查封、扣押、拍卖公司的财产等执行措施，以实现员工的合法权益。
申请强制执行的期限：
- 根据相关法律规定，申请执行的期间为二年，自法律文书规定的履行期间的最后一日起计算。因此，员工应在规定的期限内及时申请强制执行，以免错过时机。
总结来说，即使公司在劳动仲裁中不出席，员工的权益仍能得到有效保护。员工应充分准备证据和陈述，积极参与仲裁程序，并了解后续的执行流程。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。