结论前置：厂房出租时，开具“厂房租赁”发票是合法的，但前提是租赁行为本身合法且符合相关税务规定。以下从多个角度详细分析：
一、租赁行为的合法性
土地性质与规划：
- 租赁的厂房必须位于合法规划为工业用地或建筑用地的土地上。若土地为农用地或其他非建设用地，未经法定程序转为建设用地并办理相关手续，擅自建设并出租厂房属于违法行为。
- 例如，若厂房建在未经批准的农用地上，那么该租赁行为可能因土地性质不符而违法。
租赁合同的有效性：
- 出租方需拥有合法的土地使用权和厂房所有权，并有权将厂房出租。承租方应核实出租方的相关证明文件，如土地使用权证、房产证等。
- 双方签订的租赁合同应明确约定租赁厂房的用途、期限、租金等事项，并确保合同内容符合法律法规的规定。
二、税务规定的合规性
发票开具的合法性：
- 在租赁行为合法的前提下，出租方有权按照税务规定开具“厂房租赁”发票。这是出租方履行纳税义务、承租方进行财务报销的必要凭证。
- 发票的开具应遵循《中华人民共和国发票管理办法》等相关规定，确保发票的真实性、合法性和有效性。
税务申报与缴纳：
- 出租方在开具发票的同时，需按照税法规定进行税务申报和缴纳相关税费，如增值税、房产税等。
- 承租方在取得发票后，也应按照税法规定进行进项税额抵扣等税务处理。
三、特殊情况说明
集体经营性建设用地上的厂房租赁：
- 若厂房位于经依法登记的集体经营性建设用地上，且出租行为已获得本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或三分之二以上村民代表的同意，那么该租赁行为合法，可以开具“厂房租赁”发票。
租赁合同变更与续签：
- 在租赁期间，若双方对租赁合同进行变更或续签，应确保变更或续签后的合同内容仍然符合法律法规的规定，并重新办理相关税务手续（如需要）。
四、不合法的情形及后果
土地性质不符或未获审批：
- 若租赁的厂房位于土地性质不符或未获得相关审批手续的土地上，那么该租赁行为违法，出租方可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。同时，开具的“厂房租赁”发票也可能因租赁行为违法而无效。
违反税务规定：
- 若出租方未按照税务规定开具发票或进行税务申报和缴纳相关税费，那么可能面临税务机关的处罚，如罚款、滞纳金等。同时，承租方也可能因无法取得合法发票而无法进行财务报销或进项税额抵扣等税务处理。
五、建议与指导
核实土地性质与规划：
- 在签订租赁合同前，承租方应核实厂房所在土地的性质和规划用途，确保租赁行为合法。
审查租赁合同：
- 双方应仔细审查租赁合同的内容，确保合同条款明确、具体且符合法律法规的规定。
遵守税务规定：
- 出租方应按照税务规定开具发票、进行税务申报和缴纳相关税费；承租方应妥善保管发票并进行合法的税务处理。
总结：厂房出租时开具“厂房租赁”发票是合法的，但前提是租赁行为本身合法且符合相关税务规定。双方在签订租赁合同前应核实土地性质与规划、审查租赁合同内容，并在租赁期间遵守税务规定，以确保租赁行为的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。