结论：在刑事未立案的情况下，民警持有搜查证到住处搜查并扣押手机，这一行为是否合法，需结合具体情况判断，一般情况下，若搜查证合法有效且搜查程序符合法律规定，则该行为合法；但若搜查证存在瑕疵或搜查程序违法，则该行为可能不合法。
分析说明：
搜查证的合法性：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，搜查应当向被搜查人出示搜查证，但在执行逮捕、拘留的时候，遇有紧急情况，不另用搜查证也可以进行搜查。在刑事未立案的情况下，若民警已经依法取得了搜查证，且搜查证上载明了搜查的对象、范围、时间等必要信息，那么该搜查证在形式上是合法的。
- 若搜查证存在瑕疵，如未载明必要信息、超出法定权限签发等，则可能影响搜查的合法性。
搜查程序的合法性：
- 民警在执行搜查时，应当遵守法定的程序，包括向被搜查人出示搜查证、制作搜查笔录、邀请见证人等。若民警在搜查过程中未遵守这些程序，如未出示搜查证、未制作搜查笔录或未邀请见证人等，则可能构成程序违法。
- 此外，搜查应当限于与案件有关的场所、物品和人身。若民警在搜查过程中超出了这一范围，如搜查了与案件无关的场所或扣押了与案件无关的物品，则也可能构成违法。
刑事未立案的影响：
- 刑事未立案并不意味着民警不能进行搜查。在某些情况下，如为了收集犯罪证据、查获犯罪嫌疑人等，民警可以在立案前依法进行搜查。但此时，民警必须确保搜查的合法性和必要性，并严格遵守法定的程序和规定。
- 若民警在刑事未立案的情况下，未经合法程序擅自进行搜查，或者搜查行为超出了法定的范围和限度，则可能构成违法，并需要承担相应的法律责任。
特殊场景：
- 在紧急情况下，如为了防止犯罪嫌疑人逃跑、毁灭证据等，民警可能无需事先取得搜查证即可进行搜查。但这种情况下的搜查必须严格符合法律规定的紧急条件，并在事后及时补办相关手续。
行动建议：
- 若您认为民警的搜查行为存在违法或不当之处，您可以及时向当地公安机关的督察部门或上级公安机关反映情况，要求进行调查和处理。
- 同时，您也可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及如何维护自己的合法权益。
法律背景：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百三十八条规定：“进行搜查，必须向被搜查人出示搜查证。在执行逮捕、拘留的时候，遇有紧急情况，不另用搜查证也可以进行搜查。”
- 该法第一百三十九条还规定：“在搜查的时候，应当有被搜查人或者他的家属，邻居或者其他见证人在场。搜查妇女的身体，应当由女工作人员进行。”
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