法院仅以劳动者签署的不追究加班承诺书为证据判决单位不支付加班费，这一做法通常是不合法的。以下从几个角度详细分析：

1. 加班费的法律性质：

   • 加班费是劳动者因超出正常工作时间工作而应得的额外报酬，这是劳动法明确规定的劳动者的合法权益。根据《劳动法》及相关规定，用人单位安排劳动者加班的，应当按照国家有关规定支付加班费。

2. 承诺书的法律效力：

   • 劳动者签署的不追究加班承诺书，虽然表达了劳动者对加班费不追究的意愿，但这种承诺可能因违反法律强制性规定而无效。劳动法关于加班费的规定属于强制性规定，旨在保护劳动者的基本权益，因此，任何试图通过协议或承诺来免除用人单位支付加班费义务的行为，都可能被视为无效。

3. 法院判决的合法性分析：

   • 法院在审理此类案件时，应当全面审查案件事实，包括加班事实的存在、加班时间的计算、加班费的计算标准等。如果仅凭劳动者签署的不追究加班承诺书就判决单位不支付加班费，而忽略了加班事实本身和加班费的合法性，那么这样的判决可能是不合法的。
   • 法院应当依据劳动法及相关规定，判断用人单位是否确实存在加班事实，以及是否应当支付加班费。如果用人单位确实存在加班事实且未支付加班费，那么法院应当支持劳动者的诉求，判决用人单位支付加班费。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 当然，也存在一些特殊情况，比如劳动者自愿加班且明确表示不要求加班费，或者双方通过协商达成了不支付加班费的协议（但这种协议需符合法律规定，且不得损害劳动者的基本权益）。然而，在这些情况下，也需要有充分的证据来证明劳动者的真实意愿和双方的协商过程。

建议：

• 对于劳动者而言，如果遭遇用人单位不支付加班费的情况，应当及时收集证据，如加班记录、工资条等，并向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 对于用人单位而言，应当严格遵守劳动法规定，合理安排劳动者的工作时间，确保劳动者得到足够的休息和报酬。如果确实需要安排加班，应当按照国家有关规定支付加班费。

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