核心结论：针对您请假三天但老板娘未扣工资的情况，您可以根据自身意愿和实际情况，选择以下方式处理：

1. 主动沟通确认
   建议您首先与老板娘或公司财务部门主动沟通，确认未扣工资的原因。可能存在以下情况：

   • 公司制度允许：部分公司对短期请假（如3天以内）不扣工资，或通过调休、年假抵扣等方式处理；
     
   • 流程疏漏：因考勤记录未及时更新或财务计算错误导致未扣款；
     
   • 特殊情况：如您请假事由符合公司福利政策（如病假、婚假等），可能享受带薪假期。
     通过沟通可明确公司态度，避免后续纠纷。

2. 根据沟通结果决定是否补扣

   • 若公司明确要求补扣：您需配合完成工资调整，避免因工资差异引发劳动争议；
     
   • 若公司表示无需补扣：建议您要求公司出具书面说明（如邮件、微信记录），确认该行为为公司自愿给予的福利，而非疏漏，以保障自身权益；
     
   • 若您主动希望补扣：可向公司提出书面申请，明确扣除金额及原因，体现诚信态度。

3. 法律风险提示

   • 公司事后追责：若公司后续发现未扣工资并要求补扣，您需配合；若拒绝，公司可能通过调整后续工资或绩效扣除，甚至以“严重违反规章制度”为由解除劳动合同（需符合《劳动合同法》第39条）；
     
   • 税务合规性：若未扣工资导致个税计算错误，您可能需配合补缴税款及滞纳金（依据《个人所得税法》）。

建议行动步骤：

1. 优先与老板娘或HR沟通，了解未扣款的具体原因；
   
2. 根据沟通结果，决定是否补扣或要求书面确认；
   
3. 保留请假记录、沟通记录等证据，以备不时之需。
   

如有其他细节需要进一步分析（如公司规章制度、请假类型等），可随时向我补充说明，我会为您详细解答。