结论：员工约定干一年但未签合同，实际工作两个月后离职，用人单位一般不能随意扣工资，但具体还需根据实际情况判断。

分析说明：

1. 未签合同不影响工资支付义务：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。虽然双方未签订书面劳动合同，但已经形成了事实劳动关系。
   • 在事实劳动关系下，用人单位仍然有义务按照约定支付劳动者的工资。因此，员工工作两个月后离职，用人单位应当支付这两个月的工资，不能随意扣减。

2. 扣工资的合法情形：

   • 用人单位在特定情况下可以扣减工资，如劳动者因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，且用人单位能够证明损失与劳动者的行为之间存在直接因果关系。但在此情况下，扣减的工资也不得超过劳动者当月工资的20%，且扣减后的工资不得低于当地最低工资标准。
   • 如果员工离职时存在未完成的工作交接、损坏公司财物等情形，用人单位可以依据公司规章制度或相关法律法规要求员工进行赔偿，但这与直接扣减工资是不同的法律关系，需要通过合法途径进行追偿。

3. 未签合同可能面临的法律责任：

   • 虽然未签合同不影响工资支付义务，但用人单位未与劳动者签订书面劳动合同是违法的。根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。
   • 因此，员工除了有权要求用人单位支付实际工作期间的工资外，还可以要求用人单位支付未签合同期间的双倍工资差额（即一个月的工资）。

行动建议：

• 员工方面：如果用人单位拒绝支付工资或存在其他违法行为，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 用人单位方面：建议用人单位尽快与员工补签书面劳动合同，以避免法律风险。同时，在处理员工离职时，应依法支付工资并办理相关手续，避免引发不必要的劳动纠纷。

特殊场景提醒：

• 如果员工在离职时存在违反公司规章制度或法律法规的行为，用人单位在支付工资时仍需谨慎处理。可以依据公司规章制度或相关法律法规要求员工进行赔偿，但应确保赔偿的合法性和合理性，避免过度扣减工资或侵犯员工的合法权益。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。