结论：工程结清单签字后，施工单位未转款，法院是否认可结清，这并非一个简单的是非问题，而是需要结合具体情况和证据来综合判断。

分析角度一：结清单的法律效力

工程结清单，作为双方对工程款项结算的书面确认，通常具有较高的法律效力。它代表了双方对工程款项的认可和结算意愿。然而，结清单的签字并不等同于款项的实际支付。如果施工单位在结清单上签字后，并未按照约定支付款项，那么这份结清单虽然证明了双方对款项的结算意愿，但并不能直接证明款项已经支付。

分析角度二：未转款的事实与证据

在施工单位未转款的情况下，关键在于是否有证据证明这一事实。如果承包方（即收款方）能够提供银行转账记录、收款凭证等证据，证明施工单位确实未支付款项，那么法院在审理时，会倾向于认定施工单位未履行支付义务。反之，如果承包方无法提供有效证据，而施工单位又坚称已经支付，那么法院可能会根据双方提供的证据和陈述，进行综合判断。

分析角度三：合同条款与约定

除了结清单和支付证据外，合同条款也是法院审理此类案件时的重要依据。如果合同中明确规定了工程款项的支付方式、支付时间等条款，而施工单位未按照合同约定支付款项，那么承包方有权依据合同条款要求施工单位支付款项，并可能要求施工单位承担违约责任。

分析角度四：法律救济途径

在施工单位未转款的情况下，承包方可以通过法律途径来维护自己的权益。这包括向法院提起诉讼，要求施工单位支付工程款项及可能的违约金、利息等。在诉讼过程中，承包方需要提供充分的证据来证明自己的主张，包括结清单、合同条款、支付记录等。

建议：

1. 保留证据：承包方应妥善保管与工程款项支付相关的所有证据，包括结清单、合同、银行转账记录等。这些证据在后续的法律纠纷中可能起到关键作用。
2. 及时沟通：在发现施工单位未转款后，承包方应及时与施工单位进行沟通，了解原因并寻求解决方案。如果沟通无果，再考虑采取法律途径。
3. 寻求法律帮助：如果承包方对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到保障，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助承包方维护自己的权益。

可能后果：

如果法院最终认定施工单位未履行支付义务，那么施工单位可能需要承担支付工程款项、违约金、利息等法律责任。同时，施工单位的信誉也可能受到损害，影响其未来的业务发展。因此，建议施工单位在签订结清单后，务必按照约定履行支付义务，以避免不必要的法律纠纷和损失。