关于父亲和别人签土地协议儿子不同意是否有效的问题，这主要取决于父亲签订协议时的行为性质以及相关法律规定，具体分析如下：
如果父亲是以个人名义签订协议，且土地属于其个人财产：
- 在这种情况下，父亲作为土地的所有权人，有权自主决定土地的处置方式，包括签订土地协议。儿子作为家庭成员，即使不同意，也不影响父亲签订协议的法律效力。因为根据物权法的原则，所有权人对自己的不动产或者动产，依法享有占有、使用、收益和处分的权利。
如果土地属于家庭共有财产，且父亲未经其他共有人（包括儿子）同意签订协议：
- 在这种情况下，父亲的行为可能构成无权处分。根据《民法典》的相关规定，无处分权人将不动产或者动产转让给受让人的，所有权人有权追回；但是，如果受让人在受让时是善意的，且以合理的价格转让，并且已经办理了相关登记手续，那么受让人可能取得该不动产或者动产的所有权。不过，在家庭共有财产的情况下，通常要求所有共有人共同同意才能进行处分，否则可能面临协议被撤销或确认无效的风险。
- 特殊情况：如果儿子能够证明父亲签订协议时存在欺诈、胁迫等情形，或者协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么儿子可以向法院申请撤销或确认该协议无效。
如果父亲签订协议是代表家庭或基于家庭共同利益：
- 在某些情况下，父亲可能作为家庭的代表或基于家庭共同利益签订土地协议。如果这种行为得到了家庭其他成员的默认或事后追认，那么即使儿子最初不同意，该协议也可能被视为有效。因为家庭成员之间的默认或追认可以构成对父亲行为的认可。
法律建议：
- 如果儿子对父亲签订的土地协议有异议，首先应当了解协议的具体内容、签订背景以及土地的性质（是个人财产还是家庭共有财产）。
- 如果认为协议存在无效或可撤销的情形，儿子可以收集相关证据，如协议文本、沟通记录、土地权属证明等，并向法院提起诉讼或申请仲裁。
- 在处理此类纠纷时，建议儿子与父亲进行充分沟通，尝试通过协商、调解等方式解决争议，以避免不必要的法律纠纷和家庭矛盾。
可能法律后果：
- 如果协议被确认有效，儿子可能需要接受协议的内容，并承担相应的法律后果。
- 如果协议被撤销或确认无效，那么根据具体情况，可能恢复原状、赔偿损失或采取其他补救措施。
总结来说，父亲和别人签土地协议儿子不同意是否有效，取决于多种因素，包括土地的性质、父亲的行为性质以及家庭成员之间的共识等。在处理此类问题时，建议儿子咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。