仲裁委在处理单位提供两种截然不同工资单的情况时，会从证据真实性、合法性、关联性以及双方举证责任等多个角度进行审查，并根据审查结果作出裁决。具体分析如下：

1. 审查工资单的真实性与合法性
   仲裁委首先会核实两份工资单的来源及形成过程。若单位主张其中一份为“误发”或“系统错误”，需提供原始财务记录、审批流程、员工确认文件等证据证明；若员工主张单位故意提供虚假工资单，则需提供银行流水、考勤记录、同事证言等佐证实际工资水平。仲裁委将结合双方证据，判断哪份工资单更符合客观事实。

2. 分配举证责任
   根据《劳动争议调解仲裁法》第六条，发生劳动争议时，用人单位对工资支付情况负举证责任。若单位无法合理解释两份工资单的差异（如未提供完整的财务账目、审批记录等），仲裁委可能采信员工主张的工资标准；反之，若员工仅口头否认单位提供的工资单但无其他证据，则可能承担不利后果。

3. 综合认定工资标准
   若两份工资单均存在瑕疵（如均无员工签字、单位无法提供完整财务凭证），仲裁委可能结合以下因素综合认定：

   • 劳动合同中约定的工资条款；
     
   • 银行实际发放记录（需员工提供）；
     
   • 社保缴费基数、个税申报记录等第三方证据；
     
   • 行业惯例或单位同类岗位工资水平。

4. 处理单位违法行为
   若仲裁委认定单位存在伪造证据、恶意低报工资以逃避社保或经济补偿等违法行为，除按实际工资裁决外，还可能依据《劳动合同法》第八十五条，建议劳动行政部门责令单位补缴社保、支付差额工资及加付赔偿金。

建议：

• 对员工而言，务必保留银行流水、考勤记录、工资条照片等直接证据，避免仅依赖单位提供的书面材料；
  
• 对单位而言，应规范工资发放流程，确保工资单经员工签字确认，避免因证据矛盾承担不利后果。
  

如有具体案件细节（如工资单差异金额、单位解释理由等），可进一步向我说明，我会结合实务经验为您分析仲裁倾向及应对策略。