在工资由他人发放的情况下，劳动关系的认定需综合考虑多个因素，不能仅凭工资发放主体来判断劳动关系。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、劳动关系认定的核心要素
根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号），劳动关系成立需同时具备以下条件：
- 主体资格：用人单位和劳动者需符合法律、法规规定的主体资格。
- 管理与被管理关系：用人单位依法制定的各项劳动规章制度应适用于劳动者，劳动者需接受用人单位的劳动管理，并从事用人单位安排的有报酬的劳动。
- 业务组成部分：劳动者提供的劳动应是用人单位业务的组成部分。
二、工资由他人发放对劳动关系认定的影响
代发工资的性质：
- 工资支付记录是证明劳动关系的重要证据之一，但并非唯一证据。
- 即使工资由第三方代发，若劳动者实际接受用人单位的管理、指挥和监督，且工资支付是基于用人单位的指令或安排，则不影响劳动关系的认定。例如，某公司员工工资由关联公司代发，但员工实际接受该公司的考勤管理、工作分配等，此时应认定员工与该公司存在劳动关系。
代发工资与劳务派遣的区别：
- 若劳动者与派遣单位签订劳动合同并被派遣至用工单位，则与派遣单位建立劳动关系。但在此情况下，派遣协议需合法有效且实际履行，且劳动者应明确知晓自己与派遣单位存在劳动关系。
- 若工资由他人发放并非基于劳务派遣关系，而是出于其他原因（如财务安排、税务优化等），则需结合其他证据综合判断劳动关系。
三、劳动关系认定的具体方法
审查用工管理事实：
- 重点考察劳动者是否实际接受用人单位的考勤管理、工作分配、绩效考核等制度约束。例如，劳动者需遵守用人单位的考勤制度，其工作内容由用人单位直接安排并接受监督考核，即使工资由第三方发放，仍应认定为存在劳动关系。
核查业务关联性：
- 确认劳动者提供的工作内容是否属于用人单位的核心业务范围。例如，某科技公司员工虽通过外包公司代发工资，但其日常研发工作直接服务于该公司核心业务，此时应认定其与科技公司存在劳动关系。
综合分析证据链：
- 结合工作证、服务证、招聘登记表、报名表、考勤记录、证人证言等多维度证据形成完整证据链。例如，劳动者持有用人单位发放的工牌，且有同事证言证明其长期在该单位办公区工作，这些证据可佐证劳动关系的存在。
四、特殊情形下的认定规则
关联企业混同用工：
- 在实践中，劳动者可能同时与两家公司存在事实上的劳动关系，但法律上通常只能作为劳务关系处理。然而，对于关联企业之间的混同用工行为，法院可能会认定两家公司承担连带责任。例如，某劳动者同时为两家关联公司工作，且两家公司均对其进行了管理，此时法院可能会判决两家公司共同承担劳动责任。
双重劳动关系争议：
- 对于同时与多家单位存在用工事实的劳动者，需根据实质用工特征判断主要劳动关系归属。例如，某职工白天在A公司全职工作，晚间为B公司提供兼职劳务，其与A公司的全日制用工构成主要劳动关系。
五、法律建议
保留证据：
- 劳动者应妥善保留与用人单位相关的证据，如工作证、考勤记录、工资支付凭证、工作邮件等，以便在发生争议时证明劳动关系。
明确合同关系：
- 劳动者在与用人单位签订劳动合同时，应明确合同主体、工作内容、工资支付方式等关键条款，避免因合同不明确而产生争议。
及时咨询：
- 若劳动者对劳动关系认定存在疑问或争议，应及时向我咨询，以便获取专业的法律意见和帮助。
总结来说，工资由他人发放并不必然影响劳动关系的认定。在判断劳动关系时，应综合考虑劳动合同签订情况、用工管理和工作安排、劳动报酬的性质和支付情况以及其他相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。