关于工作16年后的违约金计算问题，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若违约金基于劳动合同中的服务期约定
   根据《劳动合同法》第22条，用人单位为劳动者提供专项培训费用（如出国进修、专业技能培训等）并约定服务期的，劳动者违反服务期约定需支付违约金。违约金数额不得超过服务期未履行部分所应分摊的培训费用。例如：单位支付10万元培训费，约定服务期5年，劳动者工作2年后离职，则违约金最高为10万×(³⁄₅)=6万元。
   关键点：需单位举证培训费用实际支出及服务期约定合法性，若无法证明则违约金无效。

2. 若违约金基于竞业限制协议
   根据《劳动合同法》第23条，对负有保密义务的劳动者，用人单位可约定竞业限制条款（如离职后2年内不从事同类业务），并约定经济补偿及违约金。违约金数额由双方协商确定，但需与劳动者违约造成的损失相当。例如：单位每月支付竞业限制补偿5000元，劳动者违约后单位实际损失为20万元，则违约金可能被调整为20万元左右。
   关键点：若单位未支付竞业限制补偿，劳动者可主张协议无效，无需支付违约金。

3. 若违约金无合法依据（如单纯约定“未满年限离职需支付X元”）
   根据《劳动合同法》第25条，除服务期和竞业限制外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。此类条款因违反法律强制性规定而无效，劳动者无需支付。
   典型案例：单位以“未满10年离职需支付10万元”为由索赔，法院通常不予支持。

行动建议：

• 核查劳动合同、培训协议或竞业限制协议中的具体条款；
  
• 要求单位提供培训费用发票、竞业限制补偿支付记录等证据；
  
• 若单位主张的违约金明显高于实际损失，可申请劳动仲裁调整。
  

如有进一步细节（如协议内容、单位主张金额等），可直接向我咨询，我会结合具体证据分析风险点。