合同未到期但已逾期16天时违约金的计算方式，需根据合同约定、法律规定及实际履行情况综合判断，具体分析如下：

1. 合同有明确违约金条款时
   若合同中已约定“逾期履行需支付违约金”，且条款未违反法律强制性规定（如违约金过高或过低），则直接按合同约定计算。例如：合同约定“每逾期一日，按合同总金额的0.1%支付违约金”，则违约金=合同总金额×0.1%×16天。
   注意：若违约金显著高于实际损失（如逾期16天仅造成少量利息损失），违约方可依据《民法典》第585条请求法院或仲裁机构调整（减少）；若违约金低于实际损失，守约方可请求增加。

2. 合同未约定违约金，但约定了损失赔偿计算方式时
   若合同未明确违约金，但约定了“因违约造成的损失赔偿计算方法”（如“逾期付款需按LPR利率支付利息”），则按约定赔偿实际损失。例如：合同总金额10万元，逾期16天，按当前LPR（3.45%）计算，损失赔偿≈10万×3.45%÷365×16≈151元。

3. 合同既未约定违约金，也未约定损失赔偿时
   根据《民法典》第577条，违约方需赔偿守约方因违约造成的实际损失（包括直接损失和合理预期利益损失）。例如：因逾期16天导致守约方错过商业机会，需举证证明具体损失金额（如交易利润、额外支出等），由法院或仲裁机构酌情判定。

行动建议：

• 立即核对合同条款，确认违约金或损失赔偿的约定；
  
• 若违约金过高或过低，可与对方协商调整，或通过法律途径申请调整；
  
• 保留逾期履行相关的证据（如沟通记录、损失凭证等），以备维权使用。
  

如有进一步疑问或需具体计算，可直接向我咨询。