关于单位违约金的合法计算方式，我们可以从以下几个方面进行详细阐述：
一、依据当事人约定
首先，如果合同双方当事人在合同中事先对违约金的计算方式有明确且合理的约定，那么应当按照该约定执行。这种约定可以是以违约行为造成的损失一定比例来计算，也可以直接约定具体的违约金额。重要的是，该约定不得违反法律的强制性规定，也不得违背公序良俗，只有这样，该约定才是合法有效的。
二、违约金的调整
过高调整：如果约定的违约金过分高于造成的损失，违约方有权请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。法院或仲裁机构在裁决时，会综合考虑实际损失、合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等因素，根据公平原则和诚实信用原则进行衡量。
过低调整：相反，如果约定的违约金低于造成的损失，非违约方也有权请求法院或仲裁机构予以增加，以确保其权益得到充分保护。
三、无约定时的处理
在合同中没有约定违约金的情况下，如果一方违约给另一方造成了损失，受损害方可以主张违约方赔偿因违约所造成的损失。这包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违约方在订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。
四、特定情形下的违约金计算
培训费用与违约金：在劳动合同中，如果用人单位为劳动者提供了专项培训费用，并进行了专业技术培训，同时约定了服务期，那么劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
法定违约金：在某些特定类型的合同中，如商品房买卖合同，法律法规可能对违约金有明确规定。在这种情况下，应当按照法定标准来计算违约金。
五、总结
综上所述，违约金的合法计算需要遵循以下原则：首先依据当事人的约定；其次，如果约定过高或过低，可以请求法院或仲裁机构进行调整；在无约定时，则根据实际损失进行赔偿；在特定情形下，如培训费用或法定违约金，需按照相关规定进行计算。总之，违约金的计算应当公平合理，既要保护受损方的权益，也不能过分加重违约方的负担。