计件公司故意扣费一般是不合理的，但具体是否合理还需根据实际情况和相关法律规定来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、合同角度

1. 合同约定：首先，需要查看员工与公司之间签订的劳动合同或相关协议中，是否有关于计件工资、扣费标准以及扣费情形的明确约定。如果合同中有明确规定，且扣费情形符合合同约定，那么公司的扣费行为可能是合理的。但即便如此，公司也不能随意扣费，必须确保扣费行为符合合同的具体条款和条件。

2. 合同变更：如果合同中没有明确约定扣费情形，或者公司想要变更扣费标准，那么必须与员工进行协商，并达成一致意见。未经员工同意，公司单方面变更扣费标准或进行扣费，是违法的。

二、法律角度

1. 劳动法规定：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果公司故意扣费，导致员工劳动报酬减少，那么公司的行为可能违反了劳动法的规定。

2. 工资支付规定：此外，根据《工资支付暂行规定》等法规，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果公司因为非法定原因（如员工过错、违反公司规章制度等）而扣费，且没有合理的解释和依据，那么这种行为可能构成无故克扣工资，是违法的。

三、实际操作角度

1. 扣费原因：在实际操作中，公司可能会因为各种原因进行扣费，如员工损坏公司财物、违反公司规章制度、未完成工作任务等。但即便如此，公司也必须确保扣费行为有合理的依据和程序，不能随意扣费。例如，公司需要证明员工确实存在过错或违规行为，且扣费金额与损失金额相当。

2. 员工权益保护：如果员工认为公司的扣费行为不合理或违法，可以与公司进行协商，要求公司说明扣费原因和依据。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

四、建议

1. 保留证据：如果员工遇到公司故意扣费的情况，建议保留好相关证据，如工资条、扣费通知、劳动合同等，以便在需要时证明自己的权益。

2. 及时咨询：如果员工对公司的扣费行为有疑问或不满，建议及时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。

总结来说，计件公司故意扣费一般是不合理的，但具体是否合理还需根据合同约定、法律规定以及实际操作情况来判断。如果员工遇到此类问题，建议保留好相关证据并及时咨询专业律师，以维护自己的合法权益。