工厂计件制扫码扣费是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合法情形
- 事先明确约定且符合规定
- 如果工厂在与劳动者签订的劳动合同中，或者在通过民主程序制定的规章制度里，明确规定了计件制扫码扣费的相关条款，比如因产品不合格扫码扣费、因工作失误导致物料损耗扫码扣费等具体情形和扣费标准，并且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么这种扫码扣费行为是合法的。
- 例如，工厂规定因劳动者自身原因造成产品出现严重质量问题，经检验确认后，按照该产品计件工资的一定比例进行扫码扣费，且该比例合理，不超出劳动者能够承受的范围，同时工厂也向劳动者进行了充分的说明和解释，这种情况下扫码扣费就是合法的。
- 扣费用于合理目的且程序正当
- 当扫码扣费的目的是为了弥补工厂因劳动者的过错而遭受的实际损失，并且工厂能够提供充分的证据证明损失的存在以及与劳动者过错之间的因果关系，同时扣费程序符合相关规定，如经过劳动者确认、有相应的记录等，那么这种扫码扣费也是合法的。
- 比如，劳动者在操作过程中不慎损坏了生产设备，工厂为了维修设备产生了费用，按照事先约定的方式和标准，通过扫码扣费的方式从劳动者的工资中扣除相应的维修费用，只要程序合法、证据充分，就是合理的。
违法情形
- 未事先告知或约定不明
- 如果工厂没有在劳动合同或者规章制度中明确规定计件制扫码扣费的相关内容，也没有以其他合理方式告知劳动者，就擅自进行扫码扣费，那么这种行为是违法的。
- 例如，工厂在劳动者入职时没有提及扫码扣费的事情，在劳动者工作一段时间后，突然以各种理由进行扫码扣费，劳动者对此并不知情，这种情况下扫码扣费就不合法。
- 扣费标准不合理或超出法定范围
- 即使工厂事先有关于扫码扣费的规定，但如果扣费标准过高，导致劳动者的工资低于当地最低工资标准，或者扣费比例不合理，严重损害了劳动者的合法权益，那么这种扫码扣费行为也是违法的。
- 比如，工厂规定只要产品出现一点小瑕疵就扣除该产品全部的计件工资，或者一个月内累计扣费金额超过了劳动者当月工资的一定比例（如20%），且没有合理的依据，这种情况下扫码扣费就不合法。
- 扣费目的不正当
- 如果工厂以扫码扣费为名，行克扣工资之实，比如将扫码扣费作为惩罚劳动者的手段，而不是为了弥补实际损失，或者将扣费用于工厂的非正常开支等，那么这种行为也是违法的。
- 例如，工厂老板为了个人私利，随意以各种理由对劳动者进行扫码扣费，将扣费资金据为己有，这种行为明显违反了法律规定。
如果劳动者遇到工厂计件制扫码扣费不合理或不合法的情况，可以采取以下措施：
- 与工厂进行协商，要求工厂说明扫码扣费的原因和依据，并出示相关的证据。如果工厂无法提供合理的解释和证据，劳动者可以要求工厂返还被扣的费用。
- 向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对工厂的违法行为进行调查和处理，责令工厂改正违法行为，并退还劳动者的被扣费用。
- 申请劳动仲裁，如果协商和投诉都无法解决问题，劳动者可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
如果你在劳动工伤方面还有其他问题，可以直接向我咨询。