结论前置：公司制度规定发放奖金时离职员工不得参与部门奖金发放，其合法性需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
奖金性质与发放条件
奖金作为劳动报酬的一部分：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。奖金属于工资总额的组成部分，如果公司制度或劳动合同中明确规定了奖金的发放条件，且这些条件不违反法律法规的强制性规定，那么公司应当按照约定执行。
- 举例：若公司制度规定“员工在年度内完成特定业绩目标，可享受年终奖金”，且该规定经过民主程序制定并公示，员工也完成了业绩目标，那么员工在年度内离职时，公司仍应按照约定发放年终奖金。
奖金作为福利或额外激励：
- 如果公司在规章制度中明确规定了奖金的发放条件和性质，如基于长期服务或特定条件下的福利或额外激励，并且这些规定在员工入职时已明确告知并得到员工的接受，那么公司在员工辞职时按照规定不发放奖金可能是合法的。
- 举例：公司制度规定“员工需在公司服务满一定年限，方可享受长期服务奖金”，若员工未达到该年限即离职，公司不发放该奖金则可能合法。
规章制度合法性
规章制度制定程序：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
- 分析：如果公司制度关于离职员工不得参与部门奖金发放的规定未经民主程序制定，或者未向员工公示，那么该规定可能因程序不合法而无效。
规章制度内容合理性：
- 即使公司制度经过了民主程序制定并公示，但如果其内容明显不合理，损害了劳动者的合法权益，法院可能会根据具体情况认定该规定无效。
- 举例：公司制度规定“员工在奖金发放前离职，无论何种原因，均不得享受任何奖金”，该规定可能因过于苛刻而被认定为无效。
实际操作与解决方式
查看劳动合同与奖金政策：
- 员工应首先查阅自己的劳动合同和公司的奖金政策，了解自己的权益和奖金的发放条件。
协商解决：
- 如公司拒绝支付奖金，员工可尝试与公司进行协商，要求支付足额应得的奖金。
法律途径维权：
- 协商不成时，员工可申请劳动仲裁或提起诉讼，维护自己的合法权益。申请劳动仲裁时，需准备好相关证据，如工资条、工作证、考勤记录以及单位关于奖金发放的相关规定等。劳动仲裁时效为1年，自知道或应当知道侵权行为发生之日起计算。
总结与建议：公司制度规定发放奖金时离职员工不得参与部门奖金发放，其合法性需根据奖金的性质、公司的规章制度以及员工是否满足奖金发放条件来综合判断。员工在面临此类问题时，应了解自己的权益，通过合法途径维护自己的利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。