核心结论：公司签订赔偿协议后厂子倒闭，员工或相关权益方能否获得赔偿以及如何获得赔偿，需根据具体情况判断，主要包括厂子倒闭的性质（是破产清算还是其他情况）、赔偿协议的效力及履行情况等因素。
具体分析：
- 若厂子进入破产清算程序：
- 赔偿协议的效力：如果赔偿协议是在破产清算程序启动前签订的，且协议内容合法有效，那么该协议原则上对双方仍具有约束力。但需注意，根据《企业破产法》的规定，在破产清算中，职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金等债权，享有优先受偿的权利。如果赔偿协议涉及的是上述优先受偿的债权范围，员工有权在破产财产中优先获得赔偿。
- 赔偿的履行：在破产清算过程中，管理人会接管企业的财产，并对债权进行登记和审核。员工需要向管理人申报债权，并提供赔偿协议等相关证据。管理人审核确认后，会按照破产财产的分配方案进行清偿。如果破产财产不足以清偿全部债务，员工可能只能获得部分赔偿。
- 若厂子未进入破产清算程序，而是因其他原因倒闭：
- 赔偿协议的履行：如果厂子仍有可供执行的财产，员工可以依据赔偿协议向法院提起诉讼，要求厂子履行赔偿义务。法院判决后，如果厂子拒不履行，员工可以申请法院强制执行，查封、扣押、拍卖厂子的财产以获得赔偿。
- 厂子无财产可供执行的情况：如果厂子已经没有可供执行的财产，员工可能面临无法获得赔偿的风险。但员工可以关注厂子的股东是否存在未履行出资义务、抽逃出资等情形，如果存在，可以依法追究股东的责任，要求股东在未出资或抽逃出资的范围内承担赔偿责任。
建议：
- 及时申报债权：如果厂子进入破产清算程序，员工应尽快向管理人申报债权，避免错过申报期限。
- 收集证据：无论厂子是否进入破产清算程序，员工都应收集好赔偿协议、工资单、工作证明等相关证据，以证明自己的权益。
- 咨询专业意见：由于涉及复杂的法律程序和权益保障问题，建议员工及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并制定合理的维权策略。
如有更多细节或特殊情况，欢迎继续向我咨询，我会为你提供更具体的法律建议。