结论：女职工在解除劳动合同后发现在职期间怀孕，解除协议的效力需根据具体情况判断。若解除协议存在重大误解或用人单位明知女职工怀孕仍解除合同，则解除协议可能无效，女职工有权要求恢复劳动关系或获得相应赔偿。
一、法律背景与规定
协商解除劳动合同的效力：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致可以解除劳动合同。这种解除方式在双方自愿、平等的基础上进行，通常具有法律效力。
孕期女职工的特殊保护：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条明确规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这是法律对孕期女职工的特殊保护，旨在保障其合法权益。
重大误解的认定：
- 若女职工在协商解除劳动合同时不知自己已怀孕，且这一事实对其真实意思表示产生了重大影响，则可能构成重大误解。根据法律规定，因重大误解订立的合同，当事人一方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销。
二、处理方式与策略
尝试与用人单位协商：
- 主动沟通：女职工应立即告知用人单位自己怀孕的情况，并请求恢复劳动关系。在沟通过程中，应强调法律对孕期女职工的特殊保护，以及解除协议可能存在的重大误解问题。
- 提供证据：为了支持自己的主张，女职工应提交医疗证明（如医院诊断报告）以证实怀孕的事实和时间。
法律途径维权：
- 劳动仲裁：若协商无果，女职工可以在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内申请劳动仲裁，请求撤销解除协议并恢复劳动关系或要求赔偿。
- 诉讼：对仲裁裁决不服时，女职工可以向人民法院提起诉讼，进一步维护自己的合法权益。
赔偿情况：
- 继续履行合同：若女职工选择继续履行劳动合同，用人单位应按正常工资标准支付其工资，并承担相应的社会保险费用。
- 经济赔偿：若劳动合同无法继续履行或女职工选择不继续履行，用人单位应支付赔偿金。赔偿金的数额通常根据女职工在用人单位的工作年限、工资水平等因素确定，一般为经济补偿标准的二倍。
三、司法实践中的考量因素
- 具体情况分析：法院或仲裁机构在审理此类案件时，会综合考虑协商解除劳动合同的过程、双方过错、是否存在欺诈或胁迫等因素。
- 利益平衡：在保护女职工合法权益的同时，法院或仲裁机构也会考虑用人单位的合法利益和生产经营秩序，力求实现双方利益的平衡。
四、建议与注意事项
- 保留证据：女职工应妥善保存与协商解除劳动合同相关的所有证据，包括书面协议、录音、工资条、辞退通知等。这些证据在后续维权过程中将起到至关重要的作用。
- 及时行动：一旦发现自己在协商解除劳动合同时怀孕，女职工应立即采取行动，与用人单位沟通或寻求法律帮助。时间拖得越久，可能越不利于维护自己的权益。
- 了解权益：女职工应充分了解相关法律法规，明确自己的权益和维权途径。这有助于她们在面对类似情况时做出更明智的决策。
示例：假设小张与用人单位协商解除了劳动合同，但在解除后不久发现自己在职期间已经怀孕。此时，小张可以立即与用人单位沟通，告知自己怀孕的情况，并请求恢复劳动关系。如果用人单位拒绝，小张可以申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的权益。在仲裁或诉讼过程中，小张需要提交医疗证明等证据来支持自己的主张。
最后，女职工在解除劳动合同后发现在职期间怀孕是一个复杂的问题，需要综合考虑多种因素。如果你或你身边的人遇到类似情况，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。