因违反公司规章制度被停止工作期间，工资的计算需分情况讨论，具体如下：

1. 若公司规章制度合法且员工确实存在违规行为
   根据《劳动合同法》第三十九条，若员工严重违反公司规章制度，公司可解除劳动合同且无需支付经济补偿。但在解除前若公司决定“停止工作”作为纪律处分（如停职调查），停职期间工资是否发放需分两种情形：

   • 若规章制度明确规定停职期间停发工资：需同时满足三个条件：
     
     • 规章制度经民主程序制定（如职工代表大会讨论）；
       
     • 已向员工公示或送达；
       
     • 停职期限合理（如不超过调查所需时间）。
       若符合上述条件，公司可暂停发放工资，但需保留书面证据（如停职通知、调查记录）。
       
   • 若规章制度未规定或规定违法：公司单方停发工资可能构成克扣工资，员工可依据《工资支付暂行规定》要求补发，并可主张被迫解除劳动合同的经济补偿。

2. 若公司以“停职”变相降薪或逼迫离职
   若公司无合法依据（如规章制度未规定、违规行为不成立或停职期限过长），仅以“停职”为由停发工资，可能涉及以下违法情形：

   • 未及时足额支付劳动报酬：员工可依据《劳动合同法》第三十八条主张被迫解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿（按工作年限，每满一年支付一个月工资）；
     
   • 克扣工资：员工可向劳动监察部门投诉，要求公司补发工资并加付赔偿金（克扣金额的50%-100%）。

3. 特殊情形：医疗期或工伤停职
   若员工因违规行为受伤或患病，需区分“违规”与“工伤/医疗期”性质：

   • 若被认定为工伤：即使员工存在违规行为，停工留薪期内原工资福利待遇不变，由工伤保险基金或公司支付；
     
   • 若非工伤但需医疗期：公司需按病假工资标准支付（通常为当地最低工资的80%）。

实务建议：

• 对员工：保留停职通知、工资条、规章制度等证据，若认为公司违法，可先书面提出异议，再申请劳动仲裁；
  
• 对公司：制定规章制度时需履行民主程序并公示，停职决定需书面说明理由及期限，避免滥用“停职”变相处罚。
  

如有具体细节（如规章制度内容、停职原因等），可进一步向我咨询，我会结合案例为您详细分析。