在行政诉讼中，若被告在一审时未提出原告超过诉讼时效的抗辩，那么在二审时，被告一般无权再以此为由提出抗辩。以下从不同角度对此问题进行分析：
法律依据与原则
诉讼时效抗辩的提出时机：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，诉讼时效抗辩通常应在一审期间提出。这是为了确保诉讼的效率和公正，避免一方当事人在一审中故意不提出抗辩，而在二审中突然提出，从而给对方当事人造成不公平的诉讼负担。
二审的审理范围：
- 二审法院的审理范围通常限于一审法院的审理范围和上诉请求的范围。如果被告在一审中未提出诉讼时效抗辩，且一审法院也未对此进行审理，那么二审法院一般不会主动审查诉讼时效问题，除非涉及公共利益或法律明确规定的情形。
实践中的处理
一审未提出抗辩的后果：
- 如果被告在一审中未提出诉讼时效抗辩，且一审法院也未对此进行审理，那么被告在二审中提出该抗辩时，二审法院可能会认为被告已经放弃了这一抗辩权利，从而不予支持。
例外情况：
- 尽管存在上述一般原则，但在某些特殊情况下，如被告在一审中因不可抗力或其他正当理由未能提出抗辩，且在二审中能够提供充分证据证明其抗辩理由的，二审法院可能会考虑接受其抗辩。然而，这种情况较为罕见，且需要被告提供充分的证据和理由。
法律建议
对于被告：
- 在行政诉讼中，被告应密切关注诉讼时效问题，并在一审期间及时提出抗辩。如果因故未能在一审中提出抗辩，应在二审前仔细评估是否有可能提出有效抗辩，并准备充分的证据和理由。
对于原告：
- 原告在提起行政诉讼时，也应关注诉讼时效问题，确保自己的诉讼请求在诉讼时效期间内提出。同时，在诉讼过程中，应密切关注被告的抗辩动态，及时调整自己的诉讼策略。
总结来说，在行政诉讼中，被告应在一审期间及时提出诉讼时效抗辩，以避免在二审中因未提出抗辩而面临不利后果。如果确实存在特殊情况需要在二审中提出抗辩，被告应准备充分的证据和理由，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。