在行政诉讼中，若一审未提出诉讼时效抗辩，二审提出时，法院的处理方式需分情况讨论：

1. 一审未提出诉讼时效抗辩，二审原则上不得提出
   根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国行政诉讼法〉的解释》第六十九条，被告在行政诉讼中若未在一审答辩期间提出诉讼时效抗辩，二审期间原则上不得再以此为由提出抗辩。这一规定旨在防止被告通过“诉讼技巧”拖延诉讼进程，保障原告的诉讼权利。

2. 例外情形：基于新证据或客观原因
   若被告在二审期间能证明其未在一审提出诉讼时效抗辩存在客观障碍（如不可抗力、其他正当理由），或能提供新证据证明原告起诉已超诉讼时效，法院可能对诉讼时效问题进行审查。但此类情形需严格符合法律规定的条件，实践中适用较为严格。

3. 法院主动审查诉讼时效的限制
   与民事诉讼不同，行政诉讼中法院不会主动审查诉讼时效问题，除非被告提出抗辩。若一审未提出，二审原则上视为放弃该抗辩权利，法院将重点审查行政行为的合法性，而非原告起诉是否超期。

4. 对案件结果的影响

   • 若二审法院认定被告不得提出诉讼时效抗辩，将直接审查行政行为的合法性，并作出判决。
     
   • 若二审法院认为被告的抗辩成立（如符合例外情形），可能裁定撤销一审判决，驳回原告起诉（若起诉确已超期）。

建议：

• 对被告而言，若认为原告起诉超诉讼时效，务必在一审答辩期间明确提出，并提交证据证明，避免丧失抗辩权利。
  
• 对原告而言，需关注起诉是否在法定期限内（如知道行政行为内容之日起6个月内），并保留相关证据（如行政机关告知起诉期限的材料），以应对可能的时效争议。
  

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