可以起诉要求公司赔偿。当员工发生工伤而公司不配合时，员工完全有权通过法律途径来维护自己的合法权益。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
根据《工伤保险条例》的相关规定，员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。一旦被认定为工伤，员工就有权享受工伤保险待遇，包括医疗费用、停工留薪期工资、伤残补助金等。如果公司未依法为员工缴纳工伤保险费，那么这些待遇应由公司承担。
二、公司不配合的情况及应对
公司不承认工伤：
- 如果公司不承认员工的工伤，员工可以先向当地的社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 社会保险行政部门会进行调查核实，并作出工伤认定决定。
- 如果公司对工伤认定决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，但这并不影响员工享受工伤保险待遇的权利。
公司不支付工伤保险待遇：
- 如果公司被认定为应承担工伤保险待遇的责任，但拒绝支付，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 对仲裁裁决不服的，员工可以向人民法院提起诉讼。
- 在诉讼过程中，员工需要提供充分的证据证明自己的工伤事实以及公司应承担的责任。
三、起诉赔偿的具体流程
准备证据：
- 员工需要收集与工伤相关的证据，如医疗记录、工伤认定决定书、与公司沟通的记录等。
- 这些证据将用于证明工伤事实、公司的不配合行为以及员工应享受的工伤保险待遇。
提交起诉状：
- 员工需要撰写起诉状，明确诉讼请求、事实和理由。
- 起诉状应提交给有管辖权的人民法院。
参与诉讼过程：
- 在诉讼过程中，员工需要积极参与庭审，提供证据，陈述事实和理由。
- 法院将根据双方提供的证据和法律规定作出判决。
四、可能的法律后果
如果员工胜诉：
- 公司将被判决支付员工应享受的工伤保险待遇。
- 如果公司拒不执行判决，员工可以申请强制执行。
如果员工败诉：
- 员工可能需要承担诉讼费用等不利后果。
- 但员工仍然有权在提供新证据或发现新情况后再次提起诉讼。
五、建议与提醒
- 在处理工伤纠纷时，员工应保持冷静和理性，避免与公司发生不必要的冲突。
- 员工应尽快收集证据并寻求法律帮助，以确保自己的权益得到及时维护。
- 如果员工对法律程序不熟悉或感到困惑，可以随时向我咨询，我会提供专业的法律建议和帮助。
总之，当员工发生工伤而公司不配合时，员工完全有权通过法律途径来维护自己的合法权益。希望以上分析能对你有所帮助，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。