结论：公司扣您的钱用于支付您妻子的社保费用，这一行为通常是不合法的。以下从不同角度进行分析：
社保费用的缴纳主体
- 根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位和劳动者是社会保险费用的共同缴纳主体。用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。
- 在您的情况下，您妻子的社保费用应由您妻子所在的用人单位（即您和您妻子共同工作的工厂）和她本人共同承担，而不应由您来承担。
公司扣款的合法性
- 公司无权擅自扣除您的工资或收入来支付您妻子的社保费用。这种行为侵犯了您的财产权，也违反了劳动合同的约定和劳动法的规定。
- 如果公司确实需要从员工工资中扣除某些费用，必须事先与员工协商一致，并签订书面协议。即使如此，扣除的费用也必须是合法、合理且符合劳动合同和法律法规规定的。
您的权益保护
- 如果您发现公司擅自扣除了您的钱用于支付您妻子的社保费用，您有权向公司提出异议，并要求公司立即停止这种违法行为。
- 如果公司拒绝改正，您可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，您需要提供相关证据来证明公司的违法行为，如工资条、银行转账记录等。
特殊情况考虑
- 当然，也存在一些特殊情况，比如您和公司之间有特别的约定，或者您自愿承担部分或全部您妻子的社保费用。但这种情况必须建立在双方自愿、平等、协商一致的基础上，并且需要签订书面协议来明确双方的权利和义务。
- 从您描述的情况来看，并没有提到这样的特别约定或自愿承担的情况，因此可以认为公司的行为是不合法的。