结论：在厂里受伤住院被扣工资，你可以通过以下途径来维护自己的合法权益。

核心前提：你在厂里受伤住院，这属于工伤范畴，而工厂因此扣你工资是不合理的。

具体分析与建议：

1. 确认工伤认定：

   • 首先，你需要确认自己的受伤是否已经被认定为工伤。如果尚未认定，应尽快向工厂或当地社保部门申请工伤认定。工伤认定是享受工伤保险待遇的前提，也是后续维权的基础。

2. 了解工资扣除的合法性：

   • 根据《工伤保险条例》及相关法律法规，员工因工伤住院治疗期间，工厂应支付其停工留薪期的工资。停工留薪期一般不超过12个月，具体期限由医疗机构出具证明并经劳动能力鉴定委员会确认。
   • 如果工厂在你工伤住院期间扣除了你的工资，这很可能是违法的。你有权要求工厂补发被扣除的工资，并可能获得相应的赔偿。

3. 与工厂协商：

   • 在确认工伤认定和了解工资扣除的违法性后，你可以先尝试与工厂进行协商，要求其补发工资并道歉。在协商过程中，你可以提供相关的医疗证明和工伤认定书作为证据。

4. 申请劳动仲裁：

   • 如果协商无果，你可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁时，你需要提交仲裁申请书、相关证据材料（如医疗证明、工伤认定书、工资条等）以及你的身份证明。
   • 劳动仲裁委员会将依法进行审理，并作出裁决。如果工厂不履行裁决，你还可以向法院申请强制执行。

5. 寻求法律援助或诉讼：

   • 如果你对劳动仲裁结果不满意，或者工厂拒绝履行仲裁裁决，你可以考虑寻求法律援助或向法院提起诉讼。在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来证明工厂的违法行为以及你因此遭受的损失。

额外建议：

• 在整个过程中，建议你保留好所有相关的证据材料，如医疗证明、工伤认定书、工资条、与工厂的沟通记录等。这些证据将对你后续的维权行动至关重要。
• 如果你对法律程序不熟悉或感到困惑，可以考虑咨询专业的法律人士或机构，以获取更具体的指导和帮助。我就是一名拥有多领域法律实务经验的律师，你有任何法律问题都可以直接向我咨询。