针对您提出的“协商3月31日离职，但离职申请一直没通过是否违法”的问题，这需要从多个方面来详细分析。

首先，我们要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条的规定，用人单位与劳动者协商一致，是可以解除劳动合同的。这意味着，双方需要就离职的所有相关事宜，包括离职时间、经济补偿、工作交接等，达成一致意见，并形成书面的解除协议。

现在，您提到的情况是双方已经协商了离职日期为3月31日，但离职申请一直没通过。这里有几个关键点需要注意：

1. 协商一致的原则：协商解除劳动合同必须遵循意思自治、协商一致的原则。如果双方只是初步达成了离职的意向，但并未就所有争议事项（如经济补偿数额、工作交接的具体安排等）达成一致意见，那么就不能认为双方已经协商一致解除了劳动合同。

2. 离职申请的通过：离职申请的通过通常意味着用人单位已经同意了劳动者的离职请求，并且双方就离职的所有相关事宜已经达成了一致。如果离职申请一直没通过，那么可能意味着双方在某些关键事项上还存在分歧，或者用人单位在审核过程中发现了某些问题需要进一步沟通。

3. 是否违法：要判断用人单位的行为是否违法，需要看其是否违反了相关法律法规的规定。如果用人单位在协商过程中没有违反法律法规，也没有强迫或欺骗劳动者，只是因为双方在某些事项上未能达成一致而导致离职申请未通过，那么这通常不构成违法。然而，如果用人单位在协商过程中存在违法行为，如拒绝支付应得的经济补偿、无故拖延离职申请等，那么劳动者有权依法维护自己的权益。

结合您提供的情况，如果双方只是初步协商了离职日期为3月31日，但并未就所有离职相关事宜达成一致意见，并且离职申请因为这些分歧而一直没通过，那么这通常不构成用人单位的违法行为。但是，如果用人单位在协商过程中存在违法行为或故意拖延离职申请的处理，那么您有权向相关部门投诉或寻求法律援助。

为了更好地保障自己的权益，我建议您：

• 与用人单位进一步沟通，明确双方在离职相关事宜上的分歧点，并尝试达成一致意见。
• 如果无法达成一致意见，您可以考虑咨询专业的劳动法律师或相关机构，了解自己的权益和可行的维权途径。
• 在整个过程中，保留好所有相关的证据和文件，以便在需要时能够证明自己的权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。