公司倒闭时，员工在周六、周日上班的补偿需根据具体情况确定，主要分为以下两种情况：

1. 若周六、周日属于正常排班且已支付加班费
   根据《劳动法》第四十四条，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资200%的工资报酬。若公司已按此标准支付加班费，则无需额外补偿；但若公司倒闭时未支付，员工可主张该部分加班费作为优先清偿的债权。

2. 若周六、周日属于法定休假日（如国庆、春节等）且未支付3倍工资
   法定休假日安排工作的，应支付不低于工资300%的工资报酬。若公司未支付，员工可要求补足差额，且该债权在破产清算中具有优先性。

具体操作建议：

• 第一步：收集证据
  保留劳动合同、工资条、考勤记录、加班通知等证据，证明周六、周日上班的事实及公司未支付加班费的情况。

• 第二步：向破产管理人申报债权
  公司倒闭后，法院会指定破产管理人。员工需在规定期限内向管理人申报债权，明确主张加班费及具体金额。

• 第三步：参与债权人会议
  通过债权人会议了解破产清算进展，确保加班费债权被依法列入清偿顺序（通常优先于普通债权）。

法律依据：

• 《劳动法》第四十四条
  
• 《企业破产法》第一百一十三条（破产财产清偿顺序）

若公司已支付加班费或安排补休，则无需额外补偿；若未支付，员工可通过法律途径主张权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。