结论：早上被追尾导致上班迟到，一般情况下公司不应因此扣减您的年假。是否扣减年假主要取决于公司的规章制度以及您与公司的劳动合同中的相关约定。
分析说明：
年假的性质与规定：
- 年假是劳动者在连续工作一定年限后，依法享有的带薪休假权利。其目的是为了保障劳动者的休息权，提高工作效率和生活质量。
- 根据《职工带薪年休假条例》等相关法律法规，年假的安排和使用应遵循一定的规定，且通常不应因非劳动者原因导致的迟到或旷工而被扣减。
迟到与年假扣减的关系：
- 迟到通常是由于交通拥堵、意外事件等不可抗力或个人疏忽导致的，它并不直接关联到年假的享有和使用。
- 公司规章制度中若规定迟到需扣减年假，这一条款可能因违反法律法规的强制性规定或公序良俗而无效，特别是当迟到是由于不可抗力（如交通事故）导致时。
公司规章制度与劳动合同的约定：
- 虽然公司有权制定规章制度来管理员工，但这些规章制度必须合法、合理且符合劳动合同的约定。
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了因迟到扣减年假的条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能在一定程度上有权执行这一规定。然而，在迟到是由于不可抗力导致的情况下，公司应考虑实际情况，避免不合理的扣减。
特殊场景：
- 如果您因被追尾导致严重迟到，且能够提供相关证据（如交通事故认定书、交警处理记录等），以证明迟到并非由于个人原因导致，那么公司更不应因此扣减您的年假。
行动建议：
与公司沟通：
- 首先，您可以与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，说明迟到的原因，并询问公司对于此类情况的处理方式。
- 如果公司坚持要扣减年假，您可以要求公司出示相关的规章制度或劳动合同条款，并评估其合法性和合理性。
寻求法律援助：
- 如果您认为公司的行为违反了法律法规或劳动合同的约定，且沟通无果，您可以考虑寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。
- 在此过程中，保留好相关证据（如交通事故认定书、公司规章制度、劳动合同等）将有助于您维护自己的合法权益。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《职工带薪年休假条例》等相关法律法规，劳动者享有带薪年休假的权利，且年假的安排和使用应遵循一定的规定。公司不得随意扣减劳动者的年假，除非有合法、合理的依据。
后续思考依据：
- 在处理此类问题时，您应关注公司规章制度和劳动合同中的相关条款，以及法律法规的强制性规定。同时，保留好相关证据将有助于您在需要时维护自己的合法权益。如果您对公司处理方式有疑问或不满，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。