结论：员工没有提前一个月辞职申请而突然离职，公司扣除超过20%（这里假设是指工资的20%，下同）的工资是否违法，需根据具体情况判断，一般情况下，公司扣除超过20%的工资可能构成违法，但若因员工突然离职给公司造成实际损失，且扣除部分未超过实际损失，则可能合法。
分析说明：
一般情况下的工资扣除限制：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”
- 在员工未提前一个月辞职申请而突然离职的情况下，如果并未给公司造成实际经济损失，或者造成的损失无法量化或证明，那么公司扣除员工工资超过20%的部分，就可能构成违法。
因员工突然离职造成实际损失的情况：
- 如果员工突然离职确实给公司造成了实际损失，比如因员工离职导致项目延误、客户流失等，且这些损失能够量化并证明与员工离职有直接因果关系，那么公司有权要求员工赔偿。
- 在这种情况下，公司可以从员工工资中扣除赔偿部分，但扣除的金额仍然受到上述规定的限制，即每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。如果实际损失超过了这个限制，公司需要通过其他法律途径（如诉讼）来追偿剩余损失。
特殊场景：
- 如果劳动合同中有明确约定，员工未提前通知离职需承担一定比例的违约金或赔偿金，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可以按照约定扣除相应金额。但即便如此，扣除的金额也应合理，且不得违反上述工资扣除的限制。
行动建议：
- 对于员工：如果认为公司扣除的工资不合理或违法，可以与公司协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于公司：在处理员工突然离职的情况时，应确保扣除的工资部分合法合规，避免因此引发劳动争议。如果确实因员工离职造成了实际损失，应保留好相关证据，以便在需要时通过法律途径追偿。
后续思考依据：
- 在处理此类劳动争议时，关键在于证明员工离职是否给公司造成了实际损失，以及损失的具体金额。因此，公司应建立健全的离职管理制度和损失证明机制，以便在需要时提供有力证据。
- 员工在离职时也应遵守劳动合同和法律法规的规定，提前通知公司并办理好离职手续，以避免不必要的法律纠纷。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。