核心结论：针对员工未签劳动合同超过一年且自动离职的情况，公司应采取以下措施以最大程度降低法律风险并维护自身权益：

1. 立即补签书面劳动合同（若员工仍在职）
   根据《劳动合同法》第八十二条及《劳动合同法实施条例》第七条，用人单位自用工之日起超过一个月未签书面合同的，需支付双倍工资差额（最多11个月）。但若员工已工作满一年，法律视为双方已订立无固定期限劳动合同。此时公司应立即与员工补签书面无固定期限劳动合同，并在合同中明确起始日期为“用工之日起一年”，避免后续争议。若员工拒绝补签，公司需书面通知其终止劳动关系，并依法支付经济补偿（按工作年限×月工资计算）。

2. 完善离职手续与证据留存
   若员工已自动离职，公司需：

   • 书面确认离职事实：通过邮件、短信或书面通知要求员工返岗或办理离职交接，明确其未履行请假手续且未到岗的行为视为旷工或主动离职；
     
   • 留存考勤记录：保存员工最后到岗日期、旷工天数等证据，证明其离职时间及公司已履行管理义务；
     
   • 结算工资与社保：依法结清离职前工资、加班费等，并办理社保减员手续，避免因欠薪或社保问题引发劳动仲裁。

3. 评估双倍工资差额风险并准备应对
   员工若在离职后1年内申请劳动仲裁，可能主张未签合同的双倍工资差额（最多11个月）。公司需：

   • 核查用工证据：如工资发放记录、工作证、考勤表等，证明双方存在事实劳动关系；
     
   • 主张“已订立无固定期限合同”抗辩：若员工工作满一年，公司可主张法律已视为订立无固定期限合同，无需支付双倍工资；
     
   • 协商和解：若证据不足或风险较高，可与员工协商补偿金额，降低诉讼成本。

4. 规范未来用工管理

   • 建立劳动合同签订提醒机制：对新入职员工，在入职1个月内完成合同签订，并留存员工签字确认的回执；
     
   • 定期自查用工风险：每季度核查员工合同签订、社保缴纳情况，避免类似问题再次发生；
     
   • 完善离职流程：要求员工提交书面离职申请，并办理工作交接、物品归还等手续，避免“自动离职”引发纠纷。

风险提示：若公司未及时处理，员工可能以“未签合同”为由主张双倍工资、以“违法解除”为由主张赔偿金（若公司被认定为违法终止劳动关系），或以“未缴社保”为由要求补缴社保并支付经济补偿。建议公司根据实际情况，优先通过协商或补签合同化解风险，必要时咨询专业律师制定应对方案。

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