企业关闭后三年，职工申请赔偿需根据具体情况确定赔偿项目及申请流程，核心结论如下：

1. 确认企业关闭性质及职工权益基础
   企业关闭可能涉及多种情形，如破产清算、解散注销、政策性关闭等。职工需首先明确企业关闭的具体原因及程序，因为不同情形下赔偿的法律依据和项目存在差异。例如，若企业因破产清算关闭，则适用《企业破产法》及相关司法解释；若企业因解散注销关闭，则适用《公司法》及《劳动合同法》等规定。

2. 申请赔偿的核心项目及依据

   • 经济补偿金：根据《劳动合同法》第四十四条、第四十六条及第四十七条，企业因关闭导致劳动合同终止的，应向职工支付经济补偿金。补偿标准按职工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向职工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向职工支付半个月工资的经济补偿。
     
   • 工资及加班费：企业关闭前，若存在拖欠职工工资或加班费的情况，职工有权要求企业支付。依据《劳动法》第五十条及《劳动合同法》第三十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。
     
   • 社会保险及住房公积金：企业关闭前，若未依法为职工缴纳社会保险或住房公积金，职工有权要求企业补缴。依据《社会保险法》及《住房公积金管理条例》，用人单位必须依法为职工缴纳社会保险和住房公积金。
     
   • 其他赔偿：若企业关闭过程中存在违法行为，如未提前通知职工、未依法进行清算等，职工可能还有权要求企业支付额外赔偿。具体依据相关法律法规及司法实践确定。

3. 申请赔偿的流程及注意事项

   • 收集证据：职工应首先收集与企业关闭相关的证据，如劳动合同、工资条、社保缴纳记录、企业关闭公告等，以证明自己的劳动关系及企业关闭的事实。
     
   • 协商解决：在证据充分的情况下，职工可以尝试与企业协商解决赔偿问题。协商过程中，应明确赔偿项目、金额及支付方式等关键条款。
     
   • 申请劳动仲裁：若协商无果，职工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。申请时需提交仲裁申请书、证据材料及身份证明等文件。仲裁委员会将依法进行审理并作出裁决。
     
   • 提起诉讼：若对仲裁裁决不服，职工可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。诉讼过程中，需提交起诉状、证据材料及仲裁裁决书等文件。法院将依法进行审理并作出判决。
     
   • 执行判决：若企业未履行判决或裁决确定的赔偿义务，职工可以向人民法院申请强制执行。法院将依法采取强制措施，确保职工的合法权益得到实现。
     
   • 注意时效：根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，职工应在法定期限内及时申请仲裁或提起诉讼，以免丧失维权机会。

4. 特殊情形下的赔偿申请

   • 企业破产清算：若企业因破产清算关闭，职工应向破产管理人申报债权。破产管理人将依法对债权进行审查并编制债权表。职工对债权表记载的债权有异议的，可以向受理破产申请的人民法院提起诉讼。
     
   • 企业解散注销：若企业因解散注销关闭，职工应首先要求企业清算组依法进行清算。清算过程中，清算组应优先清偿职工的工资、社会保险费用及经济补偿金等债务。若清算组未依法清偿，职工可以向人民法院申请强制清算或提起诉讼。

总结与建议：企业关闭后三年，职工申请赔偿需根据具体情况确定赔偿项目及申请流程。建议职工在维权过程中保持冷静、理性，依法收集证据并寻求专业帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。