结论：清明节仅休周日一天，法定假期加班支付正常工资，这种做法一般是不合法的。

分析如下：

1. 法定假期的规定：

   • 清明节是我国的法定节假日，通常放假一天（若与周末相连，则可能调整为连续放假）。根据《全国年节及纪念日放假办法》的规定，清明节当天属于法定节假日，劳动者在法定节假日工作的，用人单位应当按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资报酬。

2. 加班工资的计算：

   • 如果清明节当天劳动者加班，用人单位应支付3倍的工资，而不是正常工资。若用人单位仅支付正常工资，则违反了法律规定。
   • 举个例子，如果劳动者的日工资是200元，那么在清明节当天加班，用人单位应支付600元的加班费（200元×3）。

3. 休息日的调整与加班工资：

   • 如果清明节与周末相连，且用人单位通过调休的方式将周末与清明节合并放假，那么周末原本就是休息日，劳动者在休息日加班的，用人单位可以选择安排补休或者支付不低于工资200%的工资报酬。但清明节当天作为法定节假日，其加班工资的计算方式不受此影响。
   • 在您描述的情况中，如果清明节仅休周日一天，且该周日原本就是休息日，但用人单位将清明节与周日合并计算为休息日，并仅支付正常工资，这种做法也是不合法的。因为清明节作为法定节假日，其加班工资应单独计算，不受休息日调休的影响。

4. 法律后果与建议：

   • 如果用人单位违反了上述规定，劳动者有权向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁，要求用人单位支付应得的加班费。
   • 我建议您先与用人单位进行沟通协商，明确表达您的诉求和法律依据。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。

总结：清明节作为法定节假日，劳动者在当天加班应获得3倍的工资报酬。如果用人单位仅支付正常工资或者通过调休方式规避支付加班费的责任，都是不合法的。您有权要求用人单位按照法律规定支付应得的加班费，并在必要时通过法律途径来维护自己的权益。如果您还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。