关于您提出的“职务侵占16万，和公司签订协议等还完钱后，公司再起诉吗”的问题，我可以明确地告诉您，即使退还了职务侵占的款项，公司仍然有权起诉。以下是对此结论的详细解释：

1. 职务侵占的性质：

   • 职务侵占属于犯罪行为，它侵犯了公司的财产所有权。这一行为不仅损害了公司的经济利益，还破坏了公司的管理秩序和信任关系。

2. 退还款项的影响：

   • 虽然退还侵占的款项在量刑时可以作为从轻情节考虑，但这并不意味着可以免除刑事责任。退还款项只是表明犯罪嫌疑人有一定的悔罪表现，但并不能消除其犯罪行为的法律后果。

3. 公司的权利：

   • 公司作为受害者，有权通过法律途径维护自身的合法权益。即使犯罪嫌疑人退还了款项，公司仍然可以向公安机关报案，要求追究其刑事责任。

4. 法律程序：

   • 职务侵占案件属于公诉案件，司法机关会依法进行刑事追诉。退还款项并不能阻止司法机关的追诉活动。一旦案件进入刑事诉讼程序，检察院会代表国家对犯罪嫌疑人提起公诉，法院会根据相关法律进行审判，确定犯罪嫌疑人是否有罪以及应受到何种刑罚。

综上所述，即使您已经与公司签订了协议并退还了职务侵占的款项，公司仍然有权起诉您。因此，我建议您尽快咨询专业律师，了解具体的法律后果和应对措施。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。