关于劳动法加班工资支付基数，通常是以劳动合同约定的工资标准来确定，而非实发工资，但具体情形还需结合实际情况与相关法规综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、劳动合同有明确约定的情况

1. 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十三条，用人单位在劳动者完成劳动定额或规定的工作任务后，根据实际需要安排劳动者在法定标准工作时间以外工作的，应按以下标准支付工资：……（二）用人单位依法安排劳动者在休息日工作，而又不能安排补休的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付劳动者工资；……（三）用人单位依法安排劳动者在法定休假节日工作的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付劳动者工资。从这些规定可以看出，加班工资的计算基数优先参照劳动合同的约定。
2. 实际案例：假设小李与用人单位签订的劳动合同中明确约定其月工资为5000元，那么在计算加班工资时，就应以5000元作为基数。如果小李在休息日加班一天，且不能安排补休，那么他应获得的加班工资就是5000元÷21.75天（月计薪天数）×200%≈459.77元。

二、劳动合同未明确约定或约定不明确的情况

1. 处理原则：当劳动合同对加班工资计算基数没有约定或者约定不明确时，一般应结合劳动者正常工作期间的工资以及集体合同的规定等因素来合理确定。
2. 具体操作：
   • 参考正常工作期间工资：可以参照劳动者正常工作期间的实际工资收入来确定加班工资的计算基数。这里的实际工资收入应包括基本工资、奖金、津贴、补贴等货币性收入，但不包括一些非经常性的、一次性的奖金或福利。
   • 集体合同规定：如果用人单位与劳动者签订了集体合同，且集体合同中对加班工资的计算基数有明确规定，那么应按照集体合同的规定执行。
   • 地方性规定：不同地区可能还会有一些具体的地方性规定来指导加班工资计算基数的确定。例如，某些地区可能规定，在劳动合同未约定加班工资计算基数的情况下，以劳动者所在岗位相对应的正常出勤月工资的一定比例作为加班工资的计算基数。

三、实发工资与加班工资计算基数的关系

实发工资是劳动者实际收到的工资数额，它可能受到各种扣款（如社保、公积金、个人所得税等）的影响。在确定加班工资计算基数时，一般不以实发工资为准。因为实发工资可能并不能真实反映劳动者的工资水平，如果以实发工资作为加班工资的计算基数，可能会导致劳动者的加班工资权益受到损害。

建议：

• 劳动者：在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资和加班工资计算基数的约定。如果发现合同中存在不明确或不合理的地方，应及时与用人单位沟通协商，进行修改和完善。同时，要保留好与工资相关的证据，如工资条、银行流水等，以便在发生纠纷时能够维护自己的合法权益。
• 用人单位：应严格按照法律法规的规定，与劳动者明确约定加班工资的计算基数，并在实际支付加班工资时按照约定执行。避免因加班工资计算问题引发劳动纠纷，给企业带来不必要的法律风险和经济损失。

如果你在劳动法加班工资支付基数方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。