加班工资的基数既不是单纯的基本工资，也不是实发工资，而是根据劳动合同、集体合同或规章制度中约定的工资项目来确定，通常以劳动者正常工作时间的工资作为计算基数。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律依据与原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，加班工资的计算基数应当是劳动者在正常工作时间内所获得的工资报酬。这一原则确保了加班工资的公平性和合理性，避免了用人单位通过调整工资结构来规避支付加班工资的责任。

2. 加班工资基数的确定：

   • 劳动合同约定：如果劳动合同中明确约定了加班工资的计算基数，那么应当按照劳动合同的约定来执行。这是最直接、最明确的依据。
   • 集体合同约定：在没有劳动合同约定或劳动合同约定不明确的情况下，如果用人单位与劳动者签订了集体合同，且集体合同中规定了加班工资的计算基数，那么应当按照集体合同的约定来执行。
   • 规章制度规定：如果既没有劳动合同约定，也没有集体合同约定，那么用人单位应当通过民主程序制定规章制度，并在规章制度中明确加班工资的计算基数。这一基数应当合理反映劳动者在正常工作时间内所获得的工资报酬。
   • 实际履行与协商：在实际操作中，如果用人单位与劳动者对加班工资的计算基数存在争议，且双方无法达成一致意见，那么可以根据劳动者实际履行的工资情况，结合劳动合同、集体合同或规章制度的相关规定，通过协商或仲裁、诉讼等方式来确定加班工资的计算基数。

3. 特殊情况下的处理：

   • 最低工资标准：如果按照上述方法确定的加班工资计算基数低于当地最低工资标准，那么应当按照当地最低工资标准来计算加班工资。这是为了保障劳动者的基本生活需求。
   • 综合计算工时制和不定时工作制：对于实行综合计算工时制和不定时工作制的劳动者，其加班工资的计算基数和计算方法可能有所不同。具体应当根据当地的相关规定和劳动合同、集体合同或规章制度的约定来确定。

4. 举例说明：

   • 假设某劳动者的月工资为5000元，其中基本工资为3000元，绩效工资为2000元。如果劳动合同或集体合同中约定加班工资的计算基数为月工资总额（即5000元），那么该劳动者在加班时应当按照5000元作为计算基数来计算加班工资。
   • 如果劳动合同或集体合同中没有明确约定加班工资的计算基数，但用人单位的规章制度中规定以基本工资作为计算基数（且该规定不违反法律法规的强制性规定），那么该劳动者在加班时应当按照3000元作为计算基数来计算加班工资。不过，这种做法可能因地区和具体案件而有所不同，因为有些地区可能要求加班工资基数应包含更多工资项目。

建议：为了避免因加班工资计算基数而产生的争议和纠纷，用人单位应当在劳动合同、集体合同或规章制度中明确约定加班工资的计算基数和计算方法。同时，劳动者也应当了解自己的工资结构和加班工资的计算方式，以便在必要时维护自己的合法权益。如果您在加班工资方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。