公司收取员工档案管理费是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司并非员工档案的法定管理主体：

   • 通常情况下，员工的档案应由具有档案管理权限的机构（如人才市场、就业指导中心或员工原单位等）进行管理。若公司并非这些法定管理主体，却擅自收取档案管理费，这一行为可能缺乏合法依据。
   • 在这种情况下，公司收取档案管理费可能构成对员工权益的侵害，员工有权拒绝支付，并可以向相关部门（如劳动监察部门）投诉或寻求法律援助。

2. 若公司受委托代为管理员工档案：

   • 如果公司受具有档案管理权限的机构的委托，代为管理员工档案，并因此产生了合理的费用，那么公司向员工收取一定的档案管理费可能是合法的。但前提是，这一收费行为必须得到委托机构的明确授权，并且收费标准应当合理、透明。
   • 即便如此，公司也应在收取费用前，向员工明确说明收费的原因、标准和依据，并确保员工对此表示同意。若公司未经员工同意，擅自收取档案管理费，仍可能构成违法行为。

3. 从劳动合同和公司规章制度的角度分析：

   • 劳动合同是员工与公司之间约定权利和义务的重要文件。如果劳动合同中明确规定了公司可以收取档案管理费，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司收取档案管理费可能是合法的。
   • 同样，如果公司的规章制度中明确规定了档案管理费的收取标准和方式，并且这一规章制度已经过民主程序制定、公示并告知员工，那么公司按照规章制度收取档案管理费也可能是合法的。但需要注意的是，公司规章制度的内容不得违反法律法规的强制性规定，否则将被视为无效。

法律建议：

• 如果你对公司收取档案管理费的行为存在疑问，首先应查阅你的劳动合同和公司规章制度，了解其中是否有相关规定。
• 如果劳动合同和公司规章制度中没有相关规定，或者规定的内容存在模糊、不明确之处，你可以向公司的人力资源部门或相关负责人咨询，要求他们提供收费的合法依据和合理说明。
• 如果公司无法提供合法依据或合理说明，或者你认为公司的收费行为存在违法行为，你可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

可能后果：

• 如果公司收取档案管理费的行为被认定为违法，公司可能需要退还已收取的费用，并可能面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。
• 作为员工，如果你拒绝支付非法的档案管理费，公司不得以此为由对你进行处罚或解除劳动合同。否则，公司可能构成违法行为，你需要承担相应的法律责任（但此情况下主要是公司违法，员工通常无需承担责任，除非员工存在过错或违法行为）。不过，更常见的是，公司可能会通过合法途径解决争议，如协商、调解或诉讼等。