核心结论：国家承认的学历单位不计入工资，可能涉及工资结构合法性、劳动合同履行及劳动权益保障问题，需结合具体情况分析处理。以下是具体分析：

1. 先明确“学历单位不计入工资”的具体含义

• 若用人单位将学历补贴（如本科/硕士学历津贴）明确列为工资组成部分，但实际未发放，可能涉嫌克扣工资，违反《劳动合同法》第30条（用人单位应足额支付劳动报酬）。
• 若学历仅作为招聘条件或晋升参考，但未承诺与工资挂钩，则可能不涉及违法（需结合劳动合同、规章制度等证据判断）。

建议行动：

• 核查劳动合同、入职通知书、薪酬制度等文件，确认双方是否约定学历与工资的关联性。
  
• 若约定明确但未履行，可要求用人单位补发差额，并保留书面沟通记录（如邮件、聊天记录）。

2. 若用人单位以“学历不计入工资”为由调整薪酬结构

• 根据《劳动合同法》第35条，变更工资结构需双方协商一致并签订书面协议。若用人单位单方面降低工资，可能构成违法降薪，劳动者可主张补发工资并要求继续履行原合同。
  
• 特殊情况：若用人单位因经营困难需调整薪酬，需符合《劳动合同法》第40条的“客观情况重大变化”条款，并履行协商程序，否则仍属违法。

建议行动：

• 拒绝签署任何单方面降薪的协议，并书面提出异议（如邮件回复“不同意调整薪酬结构”）。
  
• 若用人单位坚持降薪，可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁，主张补发工资及经济补偿。

3. 若学历补贴属于福利而非工资

• 若学历补贴属于用人单位自主决定的福利（如交通补贴、餐补等），则法律未强制要求发放，但需符合内部规章制度。若规章制度明确学历补贴标准但未执行，可能涉及未按照规章制度支付劳动报酬，劳动者可依据《劳动合同法》第38条主张被迫解除劳动合同并要求经济补偿。

建议行动：

• 收集规章制度中关于学历补贴的条款（如员工手册、薪酬制度），证明用人单位未履行承诺。
  
• 若用人单位拒不改正，可发送书面《被迫解除劳动合同通知书》，并同步申请劳动仲裁。

4. 维权途径与注意事项

• 证据收集：劳动合同、工资条、学历证书、沟通记录（如邮件、微信）、规章制度等。
  
• 投诉渠道：向用人单位所在地劳动监察大队投诉（时效2年），或直接申请劳动仲裁（时效1年）。
  
• 风险提示：若用人单位以“学历造假”等理由反诉，需提前准备学历真实性证明（如学信网验证报告）。

总结：学历是否计入工资需以双方约定为准，若用人单位未履行约定或违法调整薪酬，劳动者可通过协商、投诉或仲裁维权。具体操作需结合证据和当地政策，如有疑问可进一步提供细节，我会为您分析具体方案。