若法院在一审、二审程序中均要求进行鉴定，但原告拒绝配合鉴定，法院通常会根据案件具体情况及鉴定必要性，作出如下处理：

1. 视为放弃举证权利，承担不利后果
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，鉴定意见属于法定证据类型之一。若法院认为鉴定是查明案件事实的关键（如医疗损害、工程质量、笔迹真伪等需专业机构判断的情形），原告拒绝配合鉴定可能被视为未完成举证责任。此时，法院可能直接认定原告主张的事实缺乏证据支持，从而驳回其诉讼请求。

2. 以现有证据认定事实，可能不利原告
   若法院认为案件事实可通过其他证据（如书证、证人证言等）综合认定，即使原告拒绝鉴定，法院也可能不直接驳回诉求，而是结合现有证据对案件作出裁判。但需注意，若鉴定是证明原告主张的唯一或主要途径，拒绝鉴定可能导致法院无法采信其主张，最终判决对其不利。

3. 二审中拒绝鉴定的特殊后果
   若一审中法院已释明鉴定必要性，原告拒绝导致败诉后，二审中若原告仍拒绝鉴定，二审法院通常不会因同一事由再次启动鉴定程序。此时，二审法院可能维持原判，或以“一审认定事实清楚、适用法律正确”为由驳回上诉。

关键提示：

• 法院要求鉴定时，通常会向原告释明拒绝鉴定的法律后果（如败诉风险），原告需谨慎评估。
  
• 若原告对鉴定程序有异议（如鉴定机构资质、鉴定范围等），应在法定期限内提出书面异议，而非直接拒绝配合。
  
• 具体处理方式需结合案件类型、鉴定必要性及证据规则综合判断，建议原告在收到法院鉴定通知后，及时咨询专业律师以制定应对策略。
  

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