在民事案件中，若原告有理由拒绝鉴定，法院的处理方式会因具体情况而异，但通常会遵循以下原则：

1. 法院会审查原告拒绝鉴定的理由：

   • 如果原告能够提出合理且正当的理由，如鉴定程序存在严重瑕疵、鉴定机构或鉴定人不具备相应资质、鉴定费用过高且不合理等，法院可能会考虑接受原告的拒绝，并综合其他证据对案件进行判决。
   • 如果原告无正当理由或理由不充分，法院可能会视为原告放弃了对相关事实的举证权利，并可能因此承担相应的不利后果。

2. 法院可能采取的措施：

   • 在某些情况下，如果鉴定对于查明案件事实至关重要，且原告拒绝鉴定的理由不成立，法院可能会依据相关法律规定，如《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，推定被告对相关证据的主张成立，从而倾向于采纳被告的观点。
   • 法院也可能根据案件的实际情况，决定是否需要依职权进行鉴定，或者要求原告提供其他能够证明其主张的证据。

3. 原告应谨慎对待鉴定申请：

   • 原告在面临鉴定申请时，应充分评估自身情况，权衡利弊后作出明智的选择。
   • 如果认为鉴定对于查明案件事实确有必要，且自身具备配合鉴定的条件，原告应积极配合鉴定，以确保自身权益得到保障。
   • 如果认为鉴定存在不合理之处或自身有正当理由拒绝鉴定，原告应及时向法院提出，并充分阐述自己的理由和依据。

综上所述，原告在民事案件中若有理由拒绝鉴定，应向法院充分阐述自己的理由和依据。法院将会根据原告的拒绝理由、案件的具体情况以及相关法律法规的规定，作出相应的处理决定。因此，原告在拒绝鉴定前应谨慎考虑，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有任何进一步的法律问题或需要更详细的咨询，请直接向我提问。