若双方同意委托的司法鉴定机构不肯进行鉴定，法院通常会根据具体情况采取以下措施：

1. 审查鉴定机构拒绝鉴定的理由：

   • 法院会首先审查鉴定机构拒绝鉴定的具体原因，包括是否存在技术难题、设备不足、人员短缺等客观因素，或者是否存在与当事人有利害关系等可能影响鉴定公正性的主观因素。
   • 若鉴定机构拒绝鉴定的理由合理且合法，法院可能会考虑更换鉴定机构或采取其他替代性解决方案。

2. 强制鉴定与不利推定：

   • 在特定情形下，如鉴定事项对案件事实认定具有关键作用，且当事人无正当理由拒不配合鉴定，法院有权依据证据规则进行事实推定。这通常意味着，若一方拒绝鉴定，法院可能会根据现有证据和法律规定，推定该方承担不利后果。
   • 例如，在医疗损害纠纷中，若患者拒绝尸检导致死因不明，且该死因对案件处理具有决定性影响，法院可能会推定医疗机构无过错或过错程度较轻。

3. 更换鉴定机构或指定鉴定：

   • 若原鉴定机构因故无法继续鉴定，或当事人对原鉴定机构提出合理异议并经法院审查属实，法院可以更换鉴定机构或指定其他具备资质的鉴定机构进行鉴定。
   • 在更换或指定鉴定机构时，法院会充分考虑当事人的意见和诉求，确保鉴定程序的公正性和合法性。

4. 法律程序中的应对措施：

   • 法官的释明义务：法官应主动向当事人说明拒绝鉴定的法律后果，包括可能承担的不利推定责任等，确保当事人充分知情后作出理性选择。
   • 程序合法性：法院在启动、推进鉴定程序时，必须严格遵循法定程序，包括鉴定机构的选定、通知送达等，避免因程序瑕疵引发质疑。
   • 文书留痕：对当事人异议及处理过程制作笔录，作为后续审查的依据，确保鉴定程序的透明度和可追溯性。

5. 替代性解决方案：

   • 对于非核心争议事项，或当事人对鉴定存在严重分歧且难以协调的情况，法院可以尝试通过调解、专家咨询等非正式程序化解分歧，避免程序僵局。
   • 调解和专家咨询等非正式程序具有灵活性和高效性，有助于在保护当事人合法权益的同时，促进案件的快速解决。

法律建议：

• 积极配合鉴定程序：当事人应充分认识到司法鉴定在诉讼中的重要性，积极配合法院和鉴定机构的工作，提供必要的资料和协助。
• 及时提出异议：若当事人对鉴定机构或鉴定程序存在异议，应及时向法院提出，并说明具体理由和依据。法院会依法审查并作出处理决定。
• 寻求法律帮助：在处理司法鉴定相关问题时，当事人可以寻求专业律师的帮助，了解自身权利和义务，制定合理的诉讼策略。

典型案例参考：

• 在一起合同纠纷案件中，双方当事人同意委托某鉴定机构对合同标的物进行质量鉴定。然而，在鉴定过程中，该鉴定机构因技术难题无法继续鉴定。法院经审查后，更换了另一家具备资质的鉴定机构进行鉴定，并最终依据鉴定结论作出了判决。

注意事项：

• 当事人在处理司法鉴定相关问题时，应确保自身行为的合法性和合理性，避免因不当行为影响鉴定程序的公正性和合法性。
• 当事人应充分了解鉴定程序的流程和要求，积极配合法院和鉴定机构的工作，确保鉴定程序的顺利进行。

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