可以申请劳动仲裁。以下是具体分析：

1. 单位应缴部分由个人缴纳的违法性
   根据《社会保险法》第六十条，用人单位必须自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的部分由单位代扣代缴，单位无权要求职工承担单位应缴部分。若单位通过扣减工资、要求职工直接转账等方式让职工承担单位应缴部分，属于违法行为。

2. 劳动仲裁的适用性
   若单位存在以下行为，职工可申请劳动仲裁：

   • 未依法缴纳社保：单位未将职工应缴部分代扣代缴至社保账户，或未缴纳单位应缴部分；
     
   • 强制职工承担单位应缴部分：通过工资扣减、现金收取等方式，将单位应缴部分转嫁给职工。
     仲裁请求可包括：要求单位补缴社保（含单位应缴部分）、返还职工已垫付的单位应缴费用、赔偿因未缴社保导致的损失（如医疗费、失业金损失等）。

3. 操作建议

   • 收集证据：保留工资条、转账记录、单位通知缴纳社保的书面材料、与单位沟通的录音/聊天记录等，证明单位要求职工承担单位应缴部分的事实；
     
   • 向社保部门投诉：根据《社会保险法》第八十六条，单位未按时足额缴纳社保的，由社保征收机构责令限期缴纳或补足，并自欠缴之日起按日加收万分之五的滞纳金。职工可先向当地社保局投诉，要求单位补缴；
     
   • 申请劳动仲裁：若社保部门处理后单位仍不补缴，或职工希望直接通过法律途径解决，可向劳动合同履行地或单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张单位返还垫付费用、补缴社保等。

总结：单位应缴部分由职工缴纳的行为违法，职工可通过劳动仲裁要求单位返还垫付费用、补缴社保。建议优先向社保部门投诉，若未解决再申请仲裁，同时注意保留关键证据。如有进一步疑问，可直接向我咨询。