结论：关于承包商在工程结算时多收取了一层楼费用，合同是否有效的问题，不能一概而论，需根据具体情况分析。以下从几个关键角度进行详细阐述：

1. 合同内容与实际履行的一致性

   • 若合同明确约定了工程范围及楼层数量，且承包商实际完成了合同约定的工程，但在结算时多计取了一层楼的费用：这种情况下，合同本身是有效的，但承包商多计取费用的行为可能构成违约或不当得利。发包方有权要求承包商按照合同约定进行结算，并退还多计取的费用。
   • 若合同未明确约定工程范围或楼层数量，但双方在实际履行过程中对工程范围有口头或书面补充约定，且承包商按照补充约定完成了工程，但在结算时多计取了一层楼的费用：此时，合同及补充约定均有效，但同样，承包商多计取费用的行为可能构成违约或不当得利，发包方有权要求调整结算金额。

2. 承包商是否存在欺诈或恶意串通

   • 若承包商在签订合同时或履行过程中存在欺诈行为，如故意隐瞒工程实际情况、虚报工程量等，导致发包方在不知情的情况下签订了合同或同意了结算金额：这种情况下，合同可能因欺诈而被撤销或变更，发包方有权要求返还多支付的款项，并可能追究承包商的法律责任。
   • 若承包商与发包方的相关人员恶意串通，通过多计取费用等方式损害发包方的利益：这种情况下，合同可能因恶意串通损害国家、集体或第三人利益而被认定为无效，相关责任人员可能面临法律制裁。

3. 结算程序的合规性

   • 若工程结算程序符合合同约定及法律法规的规定，如经过了必要的审核、审计等程序，且承包商多计取费用的行为在结算过程中未被发现或未被提出异议：这种情况下，虽然承包商多计取了费用，但结算结果可能因程序合规而具有法律效力。然而，发包方在发现后仍有权通过法律途径要求调整结算金额。
   • 若工程结算程序存在瑕疵或违规行为，如未经审核、审计等程序即进行了结算，或结算过程中存在其他违法行为：这种情况下，结算结果可能因程序瑕疵或违规行为而被撤销或变更，发包方有权要求重新进行结算。

法律建议：

• 对于发包方而言，应仔细审查合同条款及结算文件，确保工程范围、楼层数量等关键信息准确无误。如发现承包商多计取费用的情况，应及时与承包商沟通协商，要求调整结算金额；协商不成的，可通过法律途径解决争议。
• 对于承包商而言，应严格遵守合同约定及法律法规的规定，如实申报工程量及费用。如因自身原因导致多计取费用的情况发生，应主动与发包方沟通协商，积极退还多计取的费用；避免因此引发法律纠纷或损害自身信誉。

可能法律后果：

• 若合同被撤销或变更，承包商可能需要退还多计取的费用，并可能面临因违约或欺诈而产生的赔偿责任。
• 若结算结果被撤销或变更，发包方有权要求重新进行结算，并可能追究承包商因结算程序瑕疵或违规行为而产生的法律责任。

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