在多份合同均有效的情况下结算工程款，需结合合同关系类型、工程范围及实际履行情况综合判断，具体分析如下：

1. 合同关系类型决定结算逻辑

   • 独立合同关系：若多份合同针对不同工程内容（如主体工程与装修工程）或不同施工阶段（如一期与二期工程），且无主从关系，则各合同独立结算。需分别审查每份合同的价款条款、支付节点及验收标准，按实际完成工程量对应结算。
     
   • 关联合同关系：若合同存在主从关系（如总包合同与分包合同）或补充协议关系，需以主合同为基础，结合补充协议调整结算。例如，总包合同约定固定总价，分包合同约定按实结算，则总包款按固定价支付，分包款按实际工程量核算。
     
   • 合同变更情形：若后续合同对前序合同内容（如工程范围、价款）进行实质性变更，需以变更后的合同为准结算。但需注意，若变更未履行法定程序（如招标项目未重新招标），可能影响变更部分效力，需结合《民法典》第543条及行业规范判断。

2. 工程范围重叠时的处理原则

   • 明确约定优先：若合同对重叠部分（如增项工程）的价款计算方式有明确约定（如按新增工程量单独计价），直接按约定执行。
     
   • 无约定时按实际履行：若合同未约定重叠部分处理方式，需结合施工记录、验收单、签证单等证据，确定实际施工内容及对应合同。例如，同一部位由不同合同项下施工队完成，需通过工程量鉴定区分责任范围。
     
   • 避免重复结算：若重叠部分因合同条款冲突导致重复计价（如两份合同均包含基础工程），需根据《民法典》第156条，按实际履行情况及公平原则调整价款，必要时通过司法鉴定确定合理金额。

3. 实际履行情况对结算的影响

   • 履行与合同一致性：若实际施工内容与某份合同完全一致，直接按该合同结算；若部分履行，则按已完成部分对应条款结算。例如，合同约定分三期施工，仅完成两期，则按两期价款比例支付。
     
   • 履行变更的合法性：若实际履行与合同不符（如擅自变更材料规格），需审查变更是否经双方确认（如书面签证、会议纪要）。未经确认的变更，发包方有权按原合同结算；经确认的变更，按变更后内容结算。
     
   • 情势变更的适用：若因政策调整、市场波动等导致成本大幅变化，可依据《民法典》第533条主张调整价款，但需提供充分证据证明变更的不可预见性及继续履行的显失公平。

建议行动步骤：

1. 整理所有合同文本、补充协议及变更文件，标注关键条款（如价款、支付方式、违约责任）；
   
2. 收集施工过程中的全部证据（如签证单、验收报告、付款凭证），按合同分类归档；
   
3. 对比合同约定与实际履行情况，标记差异点（如工程量增减、材料变更）；
   
4. 若存在争议，优先通过协商或调解解决；协商不成，可委托造价鉴定机构出具专业报告，作为诉讼/仲裁依据。
   

如需进一步分析具体合同条款或证据材料，可随时提供详细信息，我将结合《民法典》合同编及《建设工程司法解释》为您定制解决方案。