核心结论：司法调解赔偿协议不执行本身不能直接作为认定劳动关系的依据，但可作为证明劳动关系存在的间接证据之一，认定劳动关系仍需依据其他直接证据。以下分情况详细说明：
司法调解赔偿协议的性质与作用
司法调解赔偿协议是双方在调解组织或法院主持下，就工伤赔偿等事宜达成的民事协议。其本质是民事合同，主要约束双方履行赔偿义务，不直接涉及劳动关系的认定。若协议中明确载明双方存在劳动关系（如用人单位承认员工身份、工资标准等），可作为证明劳动关系的证据之一，但需结合其他证据综合判断。
劳动关系认定的核心依据
根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号），认定劳动关系需综合以下要素：
- 主体资格：用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格；
- 管理关系：用人单位依法制定的各项劳动规章制度适用于劳动者，劳动者受用人单位的劳动管理；
- 业务组成：劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分；
- 其他证据：如工资支付记录、考勤记录、工作证、招聘登记表等。
司法调解协议不执行，仅能反映赔偿纠纷，无法直接证明上述要素。
协议不执行时的救济途径
若用人单位不履行调解协议，劳动者可：
- 申请强制执行：向法院申请强制执行调解协议内容（如赔偿款支付）；
- 申请劳动仲裁：若需确认劳动关系，可单独提起劳动仲裁，提交劳动合同、工资流水、工作记录等直接证据；
- 诉讼途径：对仲裁结果不服的，可向法院起诉。
调解协议不执行本身不改变劳动关系认定规则，但可作为辅助证据（如证明双方曾就工伤赔偿协商，间接反映劳动关系存在）。
实务建议
- 优先固定劳动关系证据：若未签订劳动合同，需尽快收集工资条、考勤记录、工作群聊天记录等；
- 调解协议需明确劳动关系：在调解时，可要求协议中明确载明“双方存在劳动关系”及具体用工信息，增强证据效力；
- 及时维权：若用人单位拒不履行协议或否认劳动关系，应在1年内申请劳动仲裁，避免超过时效。
总结：司法调解赔偿协议不执行不能直接认定劳动关系，但可作为辅助证据。劳动关系认定需以用工事实为核心，结合工资、管理、业务等直接证据。若遇纠纷，建议优先固定证据并咨询专业律师，制定具体维权方案。