结论前置：实习船员在船上工作时间不按规定8小时制，每天工作12小时，这明显违反了劳动法的相关规定。针对这种情况，你可以从以下几个角度来维护自己的合法权益。

1. 了解并确认违法事实

• 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但一般每日不得超过1小时，特殊原因下每日也不得超过3小时，且每月不得超过36小时。
• 事实确认：你需要确认自己的工作时间是否确实超出了法定标准，并保留好相关的工作记录、考勤记录等证据，以便后续维权。

2. 与用人单位沟通协商

• 沟通方式：你可以先尝试与用人单位进行友好沟通，明确表达自己的诉求和担忧，要求用人单位遵守劳动法规定，合理安排工作时间。
• 协商内容：在协商过程中，你可以提出调整工作时间、支付加班费等合理要求，并尝试与用人单位达成书面协议，以确保自己的权益得到保障。

3. 向相关部门投诉举报

• 投诉渠道：如果与用人单位沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉举报，要求劳动监察部门对用人单位的违法行为进行调查处理。
• 举报材料：在投诉举报时，你需要提供详细的工作时间记录、考勤记录等证据材料，以便劳动监察部门能够准确了解情况并作出处理。

4. 寻求法律援助或提起诉讼

• 法律援助：如果你觉得自己无法单独应对这种情况，可以寻求法律援助机构的帮助，获得专业的法律咨询和代理服务。
• 提起诉讼：在极端情况下，如果用人单位的违法行为严重损害了你的合法权益，且无法通过其他途径解决，你可以考虑向法院提起诉讼，要求用人单位承担相应的法律责任。

5. 注意事项与后续行动

• 保留证据：在整个过程中，你都需要保留好所有与工作时间、加班费等相关的证据材料，以便在需要时能够证明自己的权益。
• 关注进展：在投诉举报或提起诉讼后，你需要密切关注案件的进展情况，及时与相关部门或律师沟通联系，确保自己的权益得到及时有效的维护。

额外建议：作为实习船员，你可能对劳动法的相关规定不太熟悉。因此，我建议你多了解一些劳动法方面的知识，以便更好地维护自己的合法权益。同时，你也可以与其他同事交流分享经验，共同应对用人单位的违法行为。

最后，如果你在处理这个问题过程中遇到任何困难或疑问，都可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。