核心结论：若公司不配合撤出一级建造师注册，您可通过协商、行政投诉、仲裁或诉讼等途径解决。以下是具体分析：

1. 协商解决
   首先建议与公司友好协商，明确要求其配合办理注销或变更注册手续。可提供书面通知（如律师函或正式函件），要求公司在指定期限内完成操作，并保留送达证据（如邮寄凭证、签收记录）。若公司以拖延或拒绝回应，需及时转向其他途径。

2. 行政投诉
   根据《注册建造师管理规定》，一级建造师注册的撤销或变更需通过省级住房和城乡建设主管部门办理。您可向当地住建部门提交书面投诉材料，包括：

   • 离职证明（如劳动合同解除协议）；
     
   • 一级建造师注册证书原件及复印件；
     
   • 公司拒绝配合的证据（如沟通记录、函件等）。
     住建部门有权责令公司限期改正，逾期未改正的，可处以罚款或采取其他行政措施。

3. 劳动仲裁或诉讼
   若公司行为涉嫌侵犯您的合法权益（如挂证牟利、未支付离职补偿等），可依据《劳动合同法》申请劳动仲裁，要求公司：

   • 配合办理注册变更手续；
     
   • 赔偿因挂证导致的损失（如社保费用、税务风险等）；
     
   • 支付离职相关费用（如未结清的工资、经济补偿金）。
     若仲裁未果，可向法院提起诉讼，通过司法程序强制公司履行义务。

4. 注册系统自助操作
   部分地区的一级建造师注册管理系统支持个人发起变更或注销申请。您可登录系统，上传离职证明等材料，由原公司确认后完成手续。若公司拒绝确认，系统可能自动转入行政处理流程，此时需配合提供补充材料。

风险提示：

• 挂证行为可能面临行政处罚（如吊销证书、罚款），需确保离职后未继续以公司名义承接项目；
  
• 保留所有沟通记录和证据，避免因证据不足导致维权困难；
  
• 若公司存在恶意挂证，可向税务、市场监管等部门举报其违法经营行为。

如有进一步疑问或需协助准备材料，可直接向我咨询。