实行特殊工时制度必须经过审批。以下是对这一问题的详细分析：
一、特殊工时制度的定义与适用范围
特殊工时制度是相对于标准工时制度而言的一种工时安排，主要包括不定时工作制和综合计算工时工作制。这两种制度主要适用于因工作性质或生产特点无法按照标准工时进行工作的企业和岗位。
- 不定时工作制：适用于因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工，如高级管理人员、外勤人员、推销人员等。
- 综合计算工时工作制：适用于因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，如交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等行业中因工作性质特殊需连续作业的职工。
二、审批的必要性
根据相关法律法规，企业实行特殊工时制度必须经过劳动行政部门的审批。这一要求旨在确保特殊工时制度的合法性和合理性，同时保障劳动者的合法权益。未经审批，即便双方在劳动合同中有约定，也是无效的。
三、审批流程与材料要求
- 提交申请材料：用人单位应提交实行特殊工时制度的申请书、实施方案、职工代表大会（或全体职工）讨论意见等材料。实施方案应包括适用岗位、工时安排、休息休假制度、工资支付办法等内容。
- 审核与公示：劳动保障行政部门应对用人单位提交的申请材料进行审核，必要时可进行实地核查。审核通过后，应在官方网站或相关媒体上进行公示，接受社会监督。
- 审批决定：经公示无异议的，劳动保障行政部门应作出审批决定，并颁发《特殊工时制度许可证》。许可证应载明用人单位名称、适用岗位、工时制度类型、有效期等信息。
四、法律后果与监管
- 法律后果：如果企业未经审批擅自实行特殊工时制度，将可能面临劳动保障行政部门的处罚，包括责令改正、罚款等。同时，这种违法行为还可能影响企业的信用记录，对企业的长期发展产生不利影响。
- 监管措施：劳动保障行政部门应定期对实行特殊工时制度的用人单位进行检查和评估，确保其遵守相关法律法规和审批决定的要求。对违反特殊工时制度规定的用人单位，应记入劳动保障信用档案，并向社会公布。情节严重的，依法予以处罚。
五、建议与操作指南
用人单位操作建议：
- 在申请实行特殊工时制度前，进行充分的调研和论证，确保符合相关法律法规和审批条件的要求。
- 完善内部管理制度，明确实行特殊工时制度的岗位范围、工时安排、休息休假制度、工资支付办法等内容，并确保制度得到有效执行。
- 加强与劳动者沟通，通过职工代表大会（或全体职工）讨论等形式，充分听取劳动者的意见和建议，确保劳动者的知情权、参与权和监督权得到保障。
- 及时办理审批手续，按照规定的程序和要求提交申请材料，积极配合劳动保障行政部门的审核和检查工作。
劳动者权益保障建议：
- 了解自身权益，熟悉特殊工时制度的相关规定和自身的权益保障措施，增强自我保护意识。
- 积极参与讨论，在用人单位制定或修改特殊工时制度实施方案时，积极参与讨论并提出意见和建议。
- 及时投诉举报，如发现用人单位存在违反特殊工时制度规定的行为，应及时向劳动保障行政部门投诉举报。
综上所述，实行特殊工时制度必须经过审批，这是保障劳动者合法权益、规范用人单位用工行为的重要举措。用人单位应严格遵守相关法律法规和审批要求，确保特殊工时制度的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。