结论：公务员辞掉科长职务但单位不同意，这主要涉及到公务员辞职的相关规定和程序。你需要根据具体情况，判断是否符合辞职条件，并按照法定程序进行操作。

一、公务员辞职的法律规定

根据《中华人民共和国公务员法》的相关规定，公务员有辞职的权利，但需要满足一定的条件并遵循相应的程序。具体来说，公务员辞职应当向任免机关提出书面申请，任免机关应当自接到申请之日起三十日内予以审批，其中对领导成员职务的任免，按照国家有关规定执行。

二、针对科长职务辞职的特殊情况

1. 职务特殊性：科长作为公务员中的领导职务，其辞职可能受到更多的限制和审查。单位可能出于工作需要、人员配置等因素考虑，对你的辞职申请进行更为严格的审批。

2. 审批流程：对于领导职务的辞职，除了常规的审批流程外，可能还需要经过上级部门的批准或备案。因此，你需要了解并遵循单位内部的辞职审批流程，确保所有必要的步骤都已完成。

三、应对单位不同意的策略

1. 沟通协商：首先，你可以尝试与单位进行沟通协商，了解单位不同意辞职的具体原因，并尝试解决这些问题。例如，如果单位担心工作交接问题，你可以提出详细的交接计划或协助寻找接替人选。

2. 了解法律规定：如果沟通协商无果，你需要再次仔细研究《中华人民共和国公务员法》中关于辞职的规定，确保自己的辞职申请符合法定条件。如果单位无正当理由拒绝你的辞职申请，你可以考虑采取法律手段维护自己的权益。

3. 寻求上级部门或人事争议仲裁机构的帮助：如果单位仍然不同意你的辞职申请，你可以向上级部门反映情况或向人事争议仲裁机构申请仲裁。在申请仲裁时，你需要提供充分的证据证明自己的辞职申请符合法定条件，并说明单位拒绝辞职的违法性。

四、注意事项

1. 保持冷静和理性：在处理辞职纠纷时，保持冷静和理性至关重要。避免情绪化的行为或言论，以免加剧矛盾或影响自己的职业形象。

2. 保留相关证据：在辞职过程中，保留所有与辞职相关的证据，如辞职申请书、审批记录、沟通协商记录等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。

3. 遵守法律法规：无论最终结果如何，都要确保自己的行为符合法律法规的规定。避免采取非法手段或违反职业道德的行为来解决问题。

五、后续行动建议

如果单位最终同意你的辞职申请，你需要按照单位的要求完成工作交接等后续事宜。如果单位仍然不同意，并且你认为自己的权益受到了侵害，你可以考虑咨询我，孙芹律师，专注于劳动纠纷领域，可以为你提供更具体的法律建议和帮助。