结论：公司撤店导致劳动合同解除，员工劳动合同丢失并不影响赔偿，员工仍有权获得相应的经济补偿。
详细分析：
劳动合同丢失不影响赔偿权利：
- 劳动合同是证明劳动关系的重要文件，但并非获得经济补偿的唯一依据。即使劳动合同丢失，员工仍可以通过其他方式（如工资单、工作证、同事证言等）证明与用人单位的劳动关系。
- 在劳动争议中，用人单位有义务提供与争议事项有关的证据，包括劳动合同。如果用人单位无法提供，且员工能提供初步证据证明劳动关系存在，劳动仲裁机构或法院通常会支持员工的诉求。
公司撤店属于“客观情况发生重大变化”：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条第三项，当劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使合同无法履行，且双方未能就变更合同内容达成协议时，用人单位可以解除劳动合同，并需支付经济补偿。
- 公司撤店通常被视为“客观情况发生重大变化”，因为这直接影响了劳动合同的履行基础。
经济补偿的计算标准：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿标准按此三倍数额支付，最高不超过十二年。
计算公式：
- 经济补偿 = 工作年限 × 月工资（或当地上年度职工月平均工资的三倍，以较低者为准，且最高不超过十二年对应的金额）
无需支付经济补偿的例外情形：
- 如果员工存在《劳动合同法》第三十九条规定的情形，如试用期间不符合录用条件、严重违反规章制度、严重失职给用人单位造成重大损害等，即使公司撤店，用人单位解除劳动合同也无需支付经济补偿。
违法解除劳动合同的后果：
- 如果用人单位在公司撤店时未与员工协商变更合同，也未提前通知或支付代通知金即违法解除劳动合同，劳动者有权要求用人单位继续履行劳动合同。
- 若劳动者不要求继续履行或劳动合同已不能继续履行，用人单位需按经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
建议：
员工方面：
- 保留好与用人单位的劳动关系证明文件，如工资单、工作证、同事证言等，以备不时之需。
- 在与公司协商解除劳动合同时，明确经济补偿的金额和支付方式，并要求公司出具书面解除劳动合同通知书。
- 如与公司发生争议，及时向当地劳动仲裁机构申请仲裁，维护自己的合法权益。
公司方面：
- 在公司撤店时，应提前与员工协商变更劳动合同或解除劳动合同，并依法支付经济补偿。
- 避免违法解除劳动合同，以免承担不必要的法律责任和赔偿。
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