员工在职期间因自身疾病死亡，公司是否需要赔偿，主要取决于疾病是否与工作有关、是否构成工伤以及公司是否为员工缴纳了相关社会保险等因素。以下是对这一问题的详细分析：
一、工伤情形下的赔偿责任
视同工伤的情况：
- 根据《工伤保险条例》，如果员工在工作时间和工作岗位突发疾病死亡，或者在48小时之内经抢救无效死亡，这将被视同工伤。
- 赔偿项目及标准：
- 丧葬补助金：为6个月的统筹地区上年度职工月平均工资。
- 一次性工亡补助金：标准为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。
- 供养亲属抚恤金：按照职工本人工资的一定比例发给由因工死亡职工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属。标准为配偶每月40%，其他亲属每人每月30%，孤寡老人或者孤儿每人每月在上述标准的基础上增加10%。核定的各供养亲属的抚恤金之和不应高于因工死亡职工生前的工资。
疾病与工作直接相关：
- 如员工因接触有毒有害物质等职业因素导致疾病并最终死亡，这也可能构成工伤，公司需根据相关法律法规承担赔偿责任，具体标准和责任需依据实际情况判断。
二、非工伤情形下的赔偿责任
疾病与工作无关：
- 通常情况下，如果员工疾病与工作无关且不属于工伤范畴，公司在法律上没有必须进行赔偿的义务。
- 人道主义补偿：但出于人道主义考虑，部分公司可能会提供一定的经济援助或补偿，如支付丧葬补助费、一次性救济金等，这通常基于地方规定或公司规章制度。
社会保险缴纳情况：
- 已缴纳社保：如果公司已为员工缴纳基本养老保险等社会保险，员工因病或非因工死亡后，其遗属可以依法从社会保险基金领取丧葬补助金、抚恤金等费用，公司不承担直接赔偿责任。
- 未缴纳社保：若公司未依法为员工缴纳社会保险，导致员工家属无法享受相应的社会保险待遇，公司可能需要在应享受的保险待遇范围内承担赔偿责任，并可能面临其他法律责任。
三、具体赔偿项目和标准的进一步说明
丧葬补助金：
- 标准因地区而异，一般按照当地上年度社会月平均工资的几个月进行发放。
抚恤金：
- 抚恤金的标准与员工的缴费年限、死亡时上一年度全省企业退休人员月平均基本养老金等因素有关，具体计算方式需根据当地规定执行。对于非因工死亡的员工，抚恤金的具体数额可能因地区或政策而有所差异。
遗属生活补助费：
- 根据遗属的实际情况和需要，部分地区可能会提供遗属生活补助费以帮助维持基本生活。这通常适用于依靠去世员工生前提供主要生活来源的遗属。
四、建议与总结
- 公司角度：公司应加强社会保险缴纳意识，确保员工权益得到充分保障。同时，公司可以制定相关规章制度，明确在非工伤情形下对员工家属的人道主义补偿政策。
- 员工家属角度：如果员工因病去世，家属应详细了解当地相关政策规定和公司政策，准备好必要的申请材料，并按照规定的流程申请各项赔偿与待遇。
- 法律途径：如果公司未依法承担赔偿责任或双方对赔偿事宜存在争议，员工家属可以通过法律途径维护自身权益，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
员工在职期间因自身疾病死亡时，公司的赔偿责任并非一成不变，而是需根据多种因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。